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一、生化鑒定
（1）革蘭氏染色結果：大腸埃希氏菌為革蘭氏陰性杆菌
（2）對純培養物進行靛基質試驗、MR-VP試驗和檸檬酸鹽利用試驗。
挑取1-2個純培養的菌落至無菌生理鹽水管中充分振蕩混勻製成均一的菌懸液，打開生化鑒定條的蓋子，用75%酒精擦拭打孔器，用打孔器開孔或直接把膜撕掉；鑒定條每個孔中加入100 μL菌懸液。注：每條鑒定條含兩組生化，可鑒定兩個典型或可疑菌落。放置36℃±1℃培養。
靛基質試驗：需在培養結束後滴加靛基質試劑，立即或數秒內出現玫紅色環為陽性反應，黃色環為陰性反應
甲基紅試驗：需在培養結束後滴加甲基紅試劑，立即顯紅色為陽性反應，橙黃色為陰性反應；
V-P試驗需在培養結束後滴加V-P試劑，繼續培養4h，如出現變紅現象即為陽性反應，不變紅為陰性反應；
西蒙氏枸櫞酸鹽可直接觀察結果，如出現變藍即為陽性反應，不變色為陰性反應。
二、分離操作
將渾濁產氣的EC肉湯管混勻，取一環菌液，劃線至EMB平板（每個EMB平板編號與EC肉湯管編號對應）；同時劃線標準陽性菌大腸埃埃希氏菌，同步培養作為對照。36℃培養18-24h。
三、結果報告
典型大腸埃希氏菌為++--，非典型大腸埃希氏菌-+--，統計出現以上結果的LST管的管數，查詢MPN表，報告每g(ml)樣品中大腸杆菌的MPN值。