慢生根瘤菌屬屬於好氧或兼性厭氧非發酵革蘭氏陰性杆菌。
杆狀，0.5-0.9μm X 1.2-3.0μm。在不利生長條件下呈多形態，通常含有聚-β-羥基丁酸鹽顆粒。不產生芽孢。革蘭氏陰性。以一根極毛或亞極毛運動。好氧，以氧為末端電子受體的嚴格呼吸型。最適溫度 25-30°C, 最適pH6.0-8.0, 從酸性土壤分離的菌株可在較低的pH生長。菌落呈圓形，不透明，罕見半透明，白色和凸起，有顆粒狀結構。在酵母膏-甘露醇-無機鹽瓊脂上5-7天的菌落不超過1mm。在5～7天或更長時間的液體培養物呈中度混濁。化能異養菌，利用各種碳水化合物和有機酸作為碳源，不利用纖維素和澱粉。在含甘露醇或其他碳水化合物的無機鹽培養基上產堿。在含糖培養基上的生長物常伴有豐富的胞外粘液，有的菌株可在H2和CO2和低氧壓下營自養生活。銨鹽、硝酸鹽和有些氨基酸類可作為氮源，很少利用蛋白腖。不水解酪素和瓊脂，不產3-酮基葡萄糖苷類。細菌在寄主植物的根部膨大生成根瘤。它們可固定大氣氮到結合狀態氮（氨）為寄主植物所利用。有的菌株在特定條件下以遊離狀態固定大氣氮。相近屬的鑒別見表4-14。
模式（惟一）種：大豆慢生根瘤菌(Bradyrhizobiumjaponicum)。
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