小腸結腸炎耶爾森氏菌（Yersinia enterocolitica），簡稱小腸耶爾森氏菌，是革蘭氏陰性杆菌或球杆菌，大小為1-3.5×0.5-1.3μm，多單個散在，有時排列成短鏈或成堆。本菌不形成芽胞，無莢膜，有周鞭毛；但其鞭毛在30℃以下培養條件形成，溫度較高時即喪失，因此表現為30℃以下有動力，而35℃以上則無動力。