益生菌被認為對人類健康有著重要影響。然而，益生菌多半是通過食物、飲料或者其他攜帶益生菌的介質進入人體的。因此，如果希望通過益生菌來改善人類健康，那麽這些食品或者飲品可能會有著很大功勞。最新的研究表明，益生菌進入人體的方式（食品或者飲品），會影響益生菌對人體健康的作用。
加州大學戴維斯分校的科學家們，通過為患腸炎小鼠提供益生菌（幹酪乳杆菌BL23）的實驗發現，通過奶製品一起攜帶益生菌進入小鼠的實驗組，小鼠的症狀有明顯的減輕。幹酪乳杆菌作為一種益生菌常常被加入到奶製品中，但是實驗使用的幹酪乳杆菌BL23菌株並不是商用的添加菌，但是和商用的菌株有很高的遺傳相似性。
相比於沒有益生菌攝入的小鼠，以及非食品攝入益生菌的小鼠，實驗組（牛奶攜帶益生菌）表現出更好的恢複效果。而且，在益生菌攝入前後，小鼠小腸上皮上麵的腸道菌群的整體種群結構和比例並沒有受到很大影響。這就說明了，症狀減輕確實是因為益生菌改變了腸道的代謝。分子生物學數據顯示，通過牛奶攝入益生菌會導致小鼠的腸炎相關的細胞因子數量下降，這也證明了炎症的免疫反應下降。
這個發表在美國微生物學會期刊《Applied and Environmental Microbiology》的研究，證明了通過不同方式攝入益生菌（幹酪乳杆菌）會對小鼠產生不同影響。通過奶製品攜帶益生菌攝入會導致腸炎小鼠症狀減輕更明顯，炎症也有減少。通過奶製品攜帶的益生菌，這種微生物和環境的相互作用使得其相對於其他攝入方式，對微生物而言可能會更加利於微生物的存活或者代謝。這個研究雖然是在小鼠完成的，但是對人類可能有類似的效果。因此，通過優化不同的食物基質類型，使得食物攜帶的益生菌的效果得到最大發揮，對人體健康有著重要意義。
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