來自澳大利亞和英國的科學家們對100個胰腺癌基因組進行了最深入的分析，並著重介紹了可能有助於未來指導患者治療的4個亞型。這項研究發表在2月25日的《自然》（Nature）雜誌上。生物通 www.ebiotrade.com
該研究小組利用全基因組測序揭示出了以往隻測序蛋白質編碼基因（大約1%的基因組）時，無法看到的廣泛的“結構變異”模式。
就像衛星圖像讓我們能夠整體觀望地球，並可以放大我們選擇的細節一樣，全基因組測序同樣使得我們能夠有效地查看整體及局部的DNA損傷。生物通 www.ebiotrade.com
像大陸塊或冰架一樣，整套染色體可以打碎自身並進行重排。DNA片段可以脫離某條染色體，而與另一條染色體連接。一些基因可能被倒置、刪除或是發生擴增。
通過整體查看，新研究檢測出了“穩定”、“局部重排”、“分散”和“不穩定”4種類型的基因組重排。在某些情況下——尤其是顯示DNA修複機製缺陷的“不穩定”基因組——其自身就表明了有效的療法。生物通 www.ebiotrade.com
來自悉尼Garvan醫學研究所的Andrew Biankin教授以及昆士蘭大學分子生物學研究所(IMB)的Sean Grimmond教授共同領導了這項研究。他們與來自IMB的生物信息學家Nicola Waddell博士展開了協作，後者負責解讀了測序的結果。
在以往的一項研究中，該研究小組檢測了同一群100名患者的“外顯子組”（exome），展示出了複雜的突變景觀以及腫瘤間極大的異質性。Biankin教授說：“呈現出了成千上萬的突變基因，並且一長串的非頻發突變基因占優勢。”生物通 www.ebiotrade.com
“最後，我們真的不得不考慮轉向全基因組測序來作為診斷標準。”
“這些患者在外科手術前均簽署了同意書，我們可以追蹤他們的進展情況，將他們的生存與接受的各種治療進行比較。”生物通 www.ebiotrade.com
“全基因組測序向我們提供了比以往更為清晰的圖像。我們能夠將分析結果反映給患者，並開始看到了讀數、治療和結局之間更強的關聯。”
“許多不同類型的災難性事件都可以發生在癌症基因組中，可以慨括及籠統地將它們描述為如‘火山’、‘地震’或‘風暴’一樣的地理事件。你永遠不會目睹兩座完全相同的火山，或是兩次完全一樣的地震——但有一些相似性可以將它們進行分組。”生物通 www.ebiotrade.com
“打比方說，當你進行基因組測序時，你可以辨別出發生的是火山、地震還是局部性風暴。”
“當你隻測序外顯子組時，你或許看到了一棵倒下的樹，但你並不知道造成其倒下的原因是地震、風暴或是其他未知的因素。”生物通 www.ebiotrade.com
來自該項研究的一條有希望的線索表明了，攜帶“不穩定”基因組的患者往往會對以鉑類為基礎的損傷DNA的藥物，或有可能對阻止細胞修複DNA的、較新的PARP抑製劑產生良好的反應。
Biankin 說：“在生物學上癌症基因組是一種緩慢的方式受到損傷，這種受損的方式賦予了它一種生存優勢。如果你能夠誘導比這還要多的損傷，細胞將無法以正常細胞的方式來修複自身，它將會死亡。這就是癌症中DNA損傷劑的概念。”生物通 www.ebiotrade.com
Biankin教授計劃在英國針對胰腺癌患者開展一項臨床試驗。“例如，如果我們采用一種新型的免疫療法，並且我們沒有一種生物標誌物，我們將向所有患者提供這種療法，且我們將檢測他們的基因組看看哪些人對治療有反應，哪些人沒有。”
“我們擁有了從這項研究中獲得的各種基因組亞型——在某些情況下我們可以看到突變對應著某一特定的藥物靶點。我們將可以選擇這組患者，測試我們認為應該會起作用的療法。”生物通 www.ebiotrade.com
“我們真的需要開展一些更小型的研究，尋找更顯著的效應——並且如果我們失敗了，我們也失敗得快速且廉價，隻承擔一定程度的風險。”
胰腺癌的中位生存期為6個月，5年生存率仍然不到5%，被醫學界譽為“癌症之王”（延伸閱讀：Cell重大成果：構建“癌症之王”的類器官模型 ）。迫切需要尋找一種更好的方法來選擇患者接受當前的一些治療方法，以及開發出新的治療策略。
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