西瓜是全球重要的經濟作物和夏季消暑水果，但就是這樣一種常見的水果，人們卻始終未能從內到外了解它。過去，各國科學家雖然知道栽培西瓜遺傳多樣性狹窄是製約西瓜品種改良的主要因素，但由於基因組序列圖譜無法繪製，對於西瓜的研究就像研究一個關閉了的"黑匣子".日前，我國主導完成世界首張西瓜基因組序列圖譜的繪製與破譯。
過去4年多時間，科研團隊，采用"全基因組鳥槍法"測序策略，得到總量約為46G的基因序列數據，打開了西瓜生命活動的"黑匣子".
科研團隊發現，拚接後的序列覆蓋83.2%的西瓜基因組，共鑒定出約23440個基因，其中96.8%的基因已經精確定位到染色體上。進化分析表明，現代栽培西瓜11對染色體是由21對祖先染色體經過複雜的斷裂和融合過程進化而來。
"從半野生西瓜到現代栽培西瓜的馴化過程中，我們發現多個基因組區域受到強烈選擇，進而形成了現代栽培西瓜具有的含糖量高、早熟等生物學特征。經過重測序分析，部分抗病基因在從野生西瓜到現代栽培西瓜的進化和人工馴化過程中丟失。"郭紹貴研究員表示。
研究團隊開展了西瓜維管束與果實發育轉錄組測序，獲得了西瓜抗病性和品質等重要農藝性狀的候選基因或基因標記，並應用到育種實踐中。這項突破對推動西瓜育種和生產具有重大意義，也為破解葫蘆科作物基因組研究奠定了基礎。
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