美國科學家通過將非天然的氨基酸(除20種用作生物基礎元件的天然氨基酸之外的人造氨基酸)整合入蛋白質的多處,成功製造出了新的人造細菌菌株,其可廣泛應用於藥物研發、藥物合成、生物燃料等領域。研究發表在9月18日出版的《自然·化學生物學》雜誌上。
該研究的領導者、加州薩克生物研究所化學生物學和蛋白質組學實驗室的助理教授王磊(音譯)表示:“最新研究向我們展示了新的可能性,包括研製出能在血管中持續更長時間的藥物,或采用一種更環保的方式製造化學物質等。”
添加非天然氨基酸讓蛋白質功能更強
2001年,王磊和同事首次製造出了蛋白質中整合了非天然氨基酸的細菌;2007年,他們首次在哺乳動物細胞上運用了這項技術。首先,他們製造出了一個“擴展的遺傳代碼”,並用其覆蓋哺乳動物細胞的遺傳代碼,並指導細胞在蛋白質的構建過程中使用人造氨基酸,從而將人造氨基酸整合進蛋白質中。
王磊解釋道,添加非天然氨基酸會改變蛋白質的化學性質,在藥物研製以及化學品製造中,新蛋白質會讓得到的產品擁有更加豐富而多樣的功能。
例如,王磊和同事將受到某些顏色的光照時在顯微鏡下會發光的非天然氨基酸插入蛋白質中,便可以實時觀測到細胞內蛋白質的合成情況,因為蛋白質是大部分細胞執行其功能的基礎,這樣就有助於科學家們描述與疾病或衰老有關的生物學機製。
現在,已有人使用經過基因修改的細菌來製藥,例如用其來合成胰島素以取代動物胰腺,供糖尿病患者調節其血糖濃度。
將多個非天然氨基酸嵌入蛋白質中
雖然利用DNA(脫氧核糖核酸)重組技術將非天然氨基酸整合入蛋白質中可得到功能更加強大的蛋白質,但在擴展該技術應用範圍的前進道路上存在著一個“攔路虎”——一次隻能將一個非天然氨基酸整合入蛋白質中。
為了將一個整合過的非天然氨基酸的指令嵌入細菌的遺傳代碼中,王磊和同事利用了終止密碼子——蛋白質遺傳藍圖中特殊的代碼序列。在蛋白質的製造過程中,終止密碼子會告訴細胞機器停止朝形成蛋白質結構骨架的序列增加氨基酸。
2001年,王磊和同事修改了大腸杆菌的遺傳序列,選擇性地將一個終止密碼子嵌入其遺傳序列中,同時,他們將轉基因分子引入細菌體內,轉基因分子將一個非天然氨基酸嵌入終止密碼子內,這使細菌能產生有非天然氨基酸集成於其骨架內的蛋白質。
問題在於,名為釋放因子1(RF1)的蛋白質會阻止包含非天然氨基酸的蛋白質產生。盡管科學家們能為非天然氨基酸將終止密碼子插在遺傳序列的多個地方,然而,釋放因子會在第一個終止密碼子那兒讓蛋白質死亡,以預防包含多個非天然氨基酸的長蛋白質產生。
“為了真正地利用該技術,科學家需要能對多處含有非天然氨基酸的蛋白質進行遺傳修改,高效地製造出這些蛋白質。”王磊說,“這一點極富潛力,但此前還沒有變成現實。”
在最新研究中,薩克生物研究所的科學家和加州大學的同行解決了這個問題。既然RF1會抑製包含多個非天然氨基酸的長蛋白質的產生,所以,科學家們剔除了產生RF1的基因。但RF1基因被移除後,大腸杆菌就會死亡,因此科學家們製造出了RF1的“替身”釋放因子2(RF2),RF2能讓剔除RF1後的細菌“起死回生”。結果,科學家們得到了一個能有效地將非天然氨基酸整合在多處蛋白質的細菌。
人造細菌具有巨大應用潛力
這些合成出來的細菌在藥物研發領域擁有巨大的潛力,據此研製出的藥物擁有的生物學功能將遠超隻包含天然氨基酸的蛋白質。這些分子或許也能作為基礎元件,製造從工業溶劑到生物燃料在內的任何產品,幫助解決與石油生產和運輸有關的經濟和環境問題。 本文來自實驗室前沿
“這是我們首次製造出一個可用的、擁有多處包含非天然氨基酸的蛋白質的細菌菌株。”王磊說,“盡管這項技術還有改進空間,但這使科學家們在生物工程學領域使用非天然氨基酸幾乎就快成為現實了。”
(來源:科技日報)
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