據美國物理學家組織網7月21日(北京時間)報道,德國明斯特大學和美國生命技術公司的研究人員剛剛公布了腸出血性大腸杆菌(EHEC)的基因組草圖。研究人員稱,該草圖的公布不但有助於人們對近幾個月來在德國等多個國家暴發的EHEC疫情進行監控,還可能帶來更為有效的治療方法。相關研究成果7月20日發表在《公共科學圖書館·綜合》雜誌在線版上。
明斯特大學衛生研究所溶血性尿毒綜合征實驗室博士亞曆山大·邁爾曼說,通過將引發此次疫情的O104:H4型腸出血性大腸杆菌與2001年采集自一名溶血性尿毒症(HUS)體內的O104:H4型腸出血性大腸杆菌進行基因對比後,他們發現,兩種菌株並非同源,引起此次德國EHEC暴發的O104:H4菌株來自一種腸聚集性大腸杆菌EAEC O104:H4 55989菌株的變異,其中還摻雜了一種目前未知的由誌賀毒素產生的O104:H4菌株。
論文第一作者、明斯特大學衛生研究所教授赫希·卡赫說,這項研究再次強調了積累的重要作用。從1996年起他們就開始了溶血性尿毒症症候群等疾病的研究和生物樣本的采集工作,此前的研究對發現高致病性EHEC菌株的變異非常重要。
負責該研究的明斯特大學微生物學家達格·哈馬舍爾教授說:“多虧有了離子流個人化操作基因組測序儀(PGM)和新一代測序技術(NGS)的幫助,測序工作才能進行得如此迅速。雖然此前已有不少研究采用了新一代測序技術,但將其用於突發疫情的實時研究還尚屬首次。”
明斯特大學醫學院院長威廉·施密茨說,如此快速的測序完全可以被稱為一個“技術傑作”,其成果不但有助於對疫情的監測和診斷,還極有可能導致新療法的產生。
(來源:科技日報)
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