從菌種自身特點上區分
在目前應用的主要菌種中，乳酸杆菌屬和糞鏈球菌屬為腸道正常存在的微生物，屬於厭氧性微生態製劑，正常畜禽腸道厭氧菌占99%。在所有國內生產的微生態製劑中，乳酸菌沒能成為主推菌種的原因是，乳酸菌包被問題不能解決，乳酸菌的存活率低。瑞士百福門公司生產的賜美健係列屬於四層包被微生態，適度條件下，年菌種死亡率不超過10%，屬於畜禽飼養中首選最佳微生態產品。
而芽孢杆菌具有較高的蛋白酶、脂肪酶和澱粉酶活性，對植物性碳水化合物具有較強的降解能力。並且芽孢杆菌在顆粒料、粉料的加工過程中以及通過酸性及堿性環境的過程中具有較高的穩定性，在腸道環境中隻發揮以上作用而不增殖，符合微生物添加劑的條件。
從菌種與培養基分離與否上區分
國外微生態製劑賜美健，菌種與培養基分離，並四層包被。水溶但不堵塞飲水器，在腸道中繁殖速度快，適宜於飲水使用，多應用於5日齡~8日齡雛雞建立正常菌群時期，7日~9日注射新城疫疫苗，13日齡~15日齡注射法氏囊疫苗免疫前後；腸道疾病康複後恢複腸道菌群；不明原因的生產性能、采食量下降等。所以進口的乳酸菌多用於階段性改變生產性能時泡水使用。
酵母菌、芽胞菌國內的發酵技術較為成熟，並不做細菌、培養基分離，成本相對較低。但因為腸道繁殖幾率低，所以相對要求每克菌數含量大且存活率高。芽孢菌的耐熱性能也確定了國內芽孢菌可以通過飼料添加使用的方案。
從生產的實際需求上區分
肉雞5日齡~9日齡、13日齡~16日齡、腸道疾病恢複期、不明原因的采食量下降、雞雛生長勢態不明顯等時期，可階段性投用效果快、使用方便的泡水劑型賜美健，效果明顯；平常可一直在飼料中半劑量或更低劑量添加芽孢菌、酵母菌等。
蛋雞
飲水型賜美健的使用方法接近於在肉雞上的使用，長期在蛋雞飼料中添加微生態製劑更加必要，這對於生產性能的穩定發揮有較大的效果保障。應強調的是一定使用質量全流程控製的合格微生態產品。
豬
因豬有較長的腸道，若想提高豬的飼料轉化效率，全程添加微生態製劑更加必要。所以在豬的全程飼養上添加微生態製劑，減少促生長抗菌素的使用，對於生產合格的豬肉產品來講，微生態占據優勢。
鴨
鴨對微生態製劑的需要越來越突出，微生態製劑在提高鴨生產性能的效果上無須置疑。
（來源：三農在線）
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