1、腸套疊
一般為回腸跑進大腸，90%的小朋友會出現嘔吐、肚子痛或一陣一陣的哭鬧、肚子摸到香腸狀的腫塊、合並血便，痛時腿甚至會往肚子上抬，不痛的時候又好好的；可能會合並膽汁液的嘔吐，嚴重者會有昏睡、休克或抽搐、高燒不退的情形；發生機率為每一千位新生兒中就有一到四個，60%發生於一歲以下的小朋友，80%於兩歲以下。
七成以上的腸套疊找不到原因，目前病例中以腺病毒及輪狀病毒較明顯；開刀治療的複發率較低，約0%至3%左右。
2、膽道囊腫
雖不常見卻很重要，形成的原因一般認為在胎兒期即有某一段膽道壁較薄，日後因疸汁的累積而形成；也有另一說法為［後天］，由於胰髒酵素逆流或膽道發炎造成膽道黏膜破壞而形成。如果不治療，可能會形成膽道感染、肝硬化，甚至可能會自然破裂或因為撞擊而破裂。平均每四萬個小朋友中出現一個病例，尤其是日本及中國人比歐美國家更為常見，女孩為男孩的四倍，75%出現在16歲以前。手術切除囊腫為唯一的治療方法，可避免日後造成更嚴重的並發症。
3、兒童肝膿瘍
一般為細菌或阿米巴原蟲經由膽道或肝靜脈跑進肝髒而感染，病人大多會有發燒、肚子痛的情形，其它可能合並惡心、胸痛、咳嗽、嘔吐、右上腹痛，甚至肝腫大、黃疸；而阿米巴肝髒膿瘍則以右上腹痛為主。在台灣，克利氏菌占很大部分，其他葡萄球菌在新生兒占41%，腸內菌約占65%，其餘則為多種病菌混合生長。值得注意的是新生兒若做過臍靜脈、臍動脈插管或腹內被感染的小朋友，例如盲腸炎、胰髒炎、穿刺性外傷等、糖尿病患者、先天性鐵沈積症、血色素病變、免疫力不全、傷口感染等均需注意肝膿瘍發生的可能性。治療上除針對致病種而給予特效的抗生素外，接下來一係列的超音波追蹤是必須的。
4、過敏性紫斑
一般為是一種血管發炎的疾病，包括皮膚的紫斑或過敏症、腹痛並有時吐血、關節痛或關節炎或是並有血尿的症狀，會持續四星期，必須長期追蹤；但隻有50%小朋友可以從糞便中驗出出血狀況，且治療後亦有複發的可能。
大多發生在七歲以下的小孩，以春天為多，會在手臂、腳、臂部的伸展側等部位的皮膚在一個禮拜內出現症狀，剛開始可能隻是蕁麻疹，慢慢才轉紅，但也有人在五個月後才出現疹子；而兩歲以下的小朋友，可能會出現在臉部或頭皮，也有可能是四肢水腫。值得注意的是，六成以上會有胃腸、腳踝或膝蓋等關節問題，少部份會出現吐血或合並腸套疊等症狀，嚴重者可能會並發血壓及腎衰竭而威脅生命。治愈後若仍出現腹痛、腸胃出現、關節痛等，均建議住院以進一步治療。
5、腸病毒感染
腸病毒是一種鹹感冒引起的病毒，由糞便經口或口對口傳染，一般分為68型，包括小兒麻痹病毒、Ａ及Ｂ群克沙奇病毒、伊柯病毒及四種新型病毒(包括68及71型)。感染腸胃道時會上吐下瀉，隻要能渡過脫水的危險期，應無大礙；但身體其他地方，可能會引起發燒合並口腔、手掌、腳掌、膝蓋、臀部起小水泡(稱水足口症)；或者口腔後部長小水泡或潰瘍，引起口腔疼痛及流口水(稱為峽咽炎或咽峽炎)。
絕大多數的患兒在5至7天會自然痊愈，隻有極少數會引起嚴重的並發症，包括腦膜炎、腦炎、急性肢體無力、步履不穩、抽搐甚至肺水腫的問題；除非小朋友本身免疫力有問題，或經由特殊的機轉，很少會引起死亡；目前並無疫苗或特殊藥來預防或治療，一般均是給予支持性療法，所以建議在流行期應加強洗手(尤其處理病童的糞便後及吃飯前)、避免與患兒新吻、少出入公共場所。若小朋友出現活動力減少、嗜睡、睡覺時容易有驚嚇反射、劇烈嘔吐、呼吸困難、抽搐、肢體無力等不正常現象，須住院觀察治療。
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