根據紐約路透社報道，食品汙染菌－大腸杆菌會造成腹瀉、尿道感染以及許多人類嚴重的疾病。一份研究顯示：雞身上的大腸杆菌對氟奎諾酮類（Fluoroquinolones）的抗生素具有抗藥性，因為雞等動物被大量注射抗生素，而抗生素會導致微生物突變，使其產生抗藥性，食物鏈頂端的人類很容易從食物來源而感染抗藥性大腸杆菌。
學者指出：阻斷食物中抗藥性微生物入侵人體，最好的方法不是繼續開發更強的抗生素，而應該從其他方向著手，包括：對食品加工過程的衛生情況嚴格把關，或改用X射線、紫外線等對有疑慮的食品進行殺菌，此外，改善廚房衛生條件也很重要。
根據期刊Journal of Infectious Diseases資料，1990年後期，明尼蘇達大學研究顯示：巴塞隆納醫院某食物中毒案件，有35個病人的血液樣本及33個病人的排泄物樣本發現大腸杆菌。在同一地區的3個雞屠宰場鑒定出49個樣本也有大量大腸杆菌。其中30個人體樣本及30個及樣本均對Cipro（一種氟奎諾酮類抗生素）有抗藥性，且人與雞身上分離出的抗藥性大腸杆菌在毒性及其DNA序列都很相似。這些數據說明人體可能間接從食物（例如家禽）而感染具抗藥性的大腸杆菌。
Johnson教授強調若以上推論是正確的，那麽如何將這些致病菌從食物來源中消除，將是未來要努力的課題，因為這些具有抗藥性的病源菌對人體健康會造成嚴重的危害。
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