黃杆菌屬屬於好氧或兼性厭氧非發酵革蘭氏陰性杆菌。
直杆狀，端圓，通常為0.5μm X 1.0-3.0μm，細胞內不含聚和羥基丁酸鹽，不形成內生孢子，革蘭氏陰性。不運動，無滑動或泳動。嚴格好氧。外環境分離物可在37°C生長。在固體培養基上生長，產生典型的色素（黃色或橙色），但有些菌株不產色素。菌落半透明（偶爾為不透明），圓形（直徑1-2mm)，隆起或微隆起，光滑且有光澤，全緣。接觸酶、氧化酶、磷酸酶均陽性。不消化瓊脂。有機化能營養。在低濃度蛋白陳培養基中由碳水化合物產酸不產氣。DNA的G+Cmol％為31-45。廣泛分布在土壤和水中，在生肉、乳類和其他食物以及醫院環境和人類的臨床標本中都有檢出。
模式種：水生黃杆菌(Flavobacterium aquatile)。
黃杆菌屬內種的鑒別見表4-39。
