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PFGE概述



錄入時間:2015-4-27 10:29:04 來源:青島betway必威西汉姆联生物

PFGE的作用

 PFGE是目前分子生物學技術在準確性,特異性,分辨率,重複性最好的方法之一。

 染色體DNA經過特異性限製性內切酶的酶切作用,可以產生多條10-800kb的酶切片段,通過片斷的多少和大小來比較細菌的同源性。

 根據同源性來推斷傳染來源和途徑;為更好的作好傳染病的防治起到一定的作用。

PFGE方法步驟

一、膠塊的製備

1、刮取適量新培養的細菌均勻渾濁於含有1ml細胞懸濁液的eppendorf中,調整OD值至4.0

2、取400 μl CSBeppendorf管中置37度水浴中孵育5分鍾。

3、在水浴管中加於20 μl蛋白酶K20mg/ml)使其終濃度為05mg/ml

4、在eppendorf管中加入400 μl1%Seakem Gold1%SDS),用槍頭輕輕混勻。將混合物加入模具,避免產生氣泡,室溫下凝固10-15分鍾。

二、細胞的裂解

1、每管中加入5ml蛋白酶K/CLB混合液。

2、將以製好的膠塊加入管中,使其在液麵下,將管子放在54 ℃水浴搖床中孵育2小時,轉速約170/分鍾。

三、洗膠塊

1、從水浴搖床中取出管子,倒掉CLB,每管加入15ml預熱的純水,放回50 ℃水浴搖床中,搖15分鍾。

2、倒掉水,用純水再洗一次。

3、倒掉水,加入15ml預熱的TE,放回50 ℃水浴搖床中,搖15分鍾。

4、倒掉TE,用TE重複洗4次,每次15分鍾。

5、倒掉TE ,加入10mlTE,放在℃冰箱保存備用。

四、酶切

1、小心取出TE中的膠塊放幹淨的培養皿上。用刀片切2mm寬的膠塊放入含200μl稀釋液的eppendorf管中。放37 ℃水浴中孵育10-15分鍾。

2、槍頭吸出稀釋液,避免損傷膠塊。加入200μl酶切液,並確保膠塊在液麵下。放37 ℃水浴中孵育至少2小時。

五、加樣

1、製膠。

2、 從37 ℃水浴中取出管子,平衡到室溫。吸出酶切液,加入200μl0.5 TBE平衡。

3、用小鏟將膠塊加入加樣孔中。並用溶化的膠封閉加樣孔。

六、電泳

1、電泳槽中加入2.2L 0.5 TBE,蓋好蓋子。

2、打開主機和泵的開關。

3、打開冷凝機,確保溫度在14℃。

4、把膠放入電泳槽,設置電泳參數。

5、關機。

七、分析結果

讀膠,獲取圖像。

 

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