革蘭氏陰性兼性厭氧杆菌或球杆菌，大小為1～3.5×0.5～1.3 mm。大多以單個散在的形式分布，偶爾成短鏈狀或堆狀。
形態結構
小腸結腸炎耶爾森氏菌幼齡培養物可表現為球杆狀。不形成芽胞，無莢膜，有周身鞭毛；但鞭毛隻有在30℃以下的條件培養時才可形成，溫度較高時即喪失，因此在30℃以下有動力，而35℃以上則無動力。
培養特性
兼性厭氧，營養要求不高，4～40℃均能生長，生長最適溫度20～28℃ 。但在4 ℃也能生長，將此菌培養24 h後，可形成扁平、半透明的小菌落。
本菌在22～29℃才能使某些特性出現。4℃時能保存和繁殖。許多腸道細菌在這個溫度下則不能生長。本菌繁殖所需要的時間較長。在肉湯中生長呈均勻混濁，一般不形成菌膜。
除了生長在25 ℃比36 ℃好之外，其餘特性均類似其他的腸道細菌。 25 ℃48 h菌落直徑1 mm，生長在36 ℃隻有針尖大小。
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