金黃色葡萄球菌在自然界中無處不在，空氣、水、灰塵及人和動物的排泄物中都可找到。因而，食品受其汙染的機會很多。近年來，美國疾病控製中心報告，由金黃色葡萄球菌引起的感染占第二位，僅次於大腸杆菌。人畜化膿性感染部位常成為其汙染源 。
金黃色葡萄球菌的控製主要包括：
1）防止金黃色葡萄球菌汙染食品
防止帶菌人群對各種食物的汙染：定期對生產加工人員進行健康檢查，患局部化膿性感染（如疥瘡、手指化膿等）、上呼吸道感染（如鼻竇炎、化膿性肺炎、口腔疾病等）的人員要暫時停止其工作或調換崗位。
2）對肉製品加工廠，患局部化膿感染的禽、畜屍體應除去病變部位，經高溫或其他適當方式處理後進行加工生產。
3）防止金黃色葡萄球菌腸毒素的生成
應在低溫和通風良好的條件下貯藏食物，以防腸毒素形成；在氣溫高的春夏季，食物置冷藏或通風陰涼地方也不應超過6小時，並且食用前要徹底加熱。
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