誌賀氏菌屬沒有動力，所以沒有鞭毛抗原。
抗原構造與分型：誌賀氏菌屬細菌的抗原結構由菌體抗原（O）及表麵抗原（K）組成。
O抗原為糖脂蛋白複合物，可分為型特異性抗原和群特異性抗原。誌賀氏菌分為4個群，48個血清型（包括亞型及變種）。K抗原在誌賀菌屬分類上無意義。
菌體（0）抗原
1.型特異性抗原：化學組成為多糖，是光滑型菌株所含有的重要抗原。當菌株變為粗糙型時，此抗原也常隨之消失，根據所含的型抗原不同，可將誌賀菌屬分為A、B、C、D四個群及39個抗原型。
2.群特異性抗原：為光滑型菌株的次要抗原，也是菌體抗原的一種。特異性較低，主要存在於B群。根據所含的群抗原不同，可將一些菌型分為多種亞型。
表麵抗原（K抗原）
在新分離的某些菌株菌體表麵含有此種抗原。不耐熱，加熱100℃1小時即被破壞。具有此種抗原的菌株，可阻止菌體抗原與相應免疫血清發生凝集。
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