淡水動物性水產品養殖和銷售加工過程監測
副溶血性弧菌是一種嗜鹽菌，一般認為隻汙染海水動物性水產品，然而從2010 年-2012 年常規監測結果可見，淡水動物性水產品中副溶血弧菌的汙染率和汙染水平不亞於海水動物性水產品，因此在2014 年擬啟動淡水動物性水產品養殖、銷售、加工、餐飲等過程的專項監測，了解淡水動物性水產品中副溶血弧菌的汙染原因，確定汙染環節，為降低淡水產品中副溶血性弧菌的汙染提出控製措施。
嬰兒配方食品加工過程監測
嬰幼兒配方食品一直是近幾年的監測和監管重點，目前正在開展的嬰兒配方食品加工過程監測主要針對阪崎腸杆菌進行了監測，2014 年擬繼續開展該項目的監測，但監測重點專項蠟樣芽孢杆菌，以了解原料及其存放環境、加工過程、包裝過程、終產品的衛生狀況，蠟樣芽孢杆菌的分布和汙染程度；及時對監測結果進行評價和報告，評價現有衛生程序和控製措施的有效性，掌握關鍵控製點，製定適當的幹預措施指導安全生產；收集生產加工各個環節中阪崎腸杆菌、蠟樣芽胞杆菌的汙染數據，為風險評估提供基礎數據。
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