專項監測
專項監測包括5 個，主要為淡水動物性水產品養殖和銷售加工過程、嬰兒配方食品加工過程、餐飲店和飲品店自製飲料/食用冰等、學生餐和外賣配送餐。
包括衛生指示菌、食源性致病菌。具體指標的監測目的和依據如下：
淡水動物性水產品養殖和銷售加工過程監測
副溶血性弧菌是一種嗜鹽菌，一般認為隻汙染海水動物性水產品，然而從2010 年-2012 年常規監測結果可見，淡水動物性水產品中副溶血弧菌的汙染率和汙染水平不亞於海水動物性水產品，因此在2014 年擬啟動淡水動物性水產品養殖、銷售、加工、餐飲等過程的專項監測，了解淡水動物性水產品中副溶血弧菌的汙染原因，確定汙染環節，為降低淡水產品中副溶血性弧菌的汙染提出控製措施
嬰兒配方食品加工過程監測
嬰幼兒配方食品一直是近幾年的監測和監管重點，目前正在開展的嬰兒配方食品加工過程監測主要針對阪崎腸杆菌進行了監測，2014 年擬繼續開展該項目的監測，但監測重點專項蠟樣芽孢杆菌，以了解原料及其存放環境、加工過程、包裝過程、終產品的衛生狀況，蠟樣芽孢杆菌的分布和汙染程度；及時對監測結果進行評價和報告，評價現有衛生程序和控製措施的有效性，掌握關鍵控製點，製定適當的幹預措施指導安全生產；收集生產加工各個環節中阪崎腸杆菌、蠟樣芽胞杆菌的汙染數據，為風險評估提供基礎數據。
餐飲店和飲品店自製飲料、食用冰等
監測項目為菌落總數、大腸菌群。此外，同時對該類食品中的化學和微生物有害因素進行全麵監測，以全麵掌握產品安全狀況，發現安全隱患。
學生餐
近幾年，由於學生餐引起的學校群體性食物中毒事件接連發生，引起全社會的廣泛關注。因此，2014 年全國食品安全風險監測擬同時對學生餐進行監測，以發現隱患，掌握產品的安全狀況。作為高風險食品，從監測項目和監測數量上均予以偏重，其中監測項目包括菌落總數、大腸埃希氏菌計數、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、蠟樣芽孢杆菌、單核細胞增生李斯特氏菌、致瀉大腸埃希氏菌等，明確要求樣品采集應覆蓋城市和農村，包括城鄉結合部。
外賣配送餐
隨著工作節奏的加快，生活習慣的改變，外賣配送餐作為一種新的消費方式不斷壯大，然而其加工衛生狀況、運輸溫度和時間導致的安全性隱患也成為消費者關注的熱點。因此，2014 年全國食品安全風險監測擬開展外賣配送餐的監測，以發現隱患，掌握產品的安全狀況。作為高風險食品，從監測項目和監測數量上均予以偏重，其中監測項目包括菌落總數、大腸埃希氏菌計數、金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、蠟樣芽孢杆菌、單核細胞增生李斯特氏菌、致瀉大腸埃希氏菌等，明確要求樣品采集應覆蓋城市和農村，包括城鄉結合部。
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