共生（symbiosis）：兩種生物共居一起分工協作、相依為命與合二為一的依存關係。
寄生（parasitism）：指小型生物生活在另一種較大型生物的體內或表麵吸取營養生長而使後者蒙難。
互生（metabiosis）：兩種獨生的生物生活在一起時各自代謝活動有利於對方，即可分可合，合比分好。
拮抗（antagonism）：係指共居在一起的生物由於它種生物分泌拮抗物而受抑或被殺。
捕食：生物間捕食微主要為存生動物吞食細菌和藻類現象。
1.互生
人體腸道正常菌群
腸道正常菌群與人體間以互生為主，有時轉化為寄生（病態）；在腸道正常菌群間則存在著共生、互生、寄生與拮抗等複雜菌相動態平衡。
數量：60～400種微生物，總數100萬億
優勢菌：厭氧G-的擬杆菌，含量可達10～100億/克濕糞，好氧菌<1%
功能：多方麵,400 ~ 650ml/日產氣量
微生態製劑
定義：是依據微生態學理論製成的含有益菌的活菌製劑
功能：a）維持宿主的微生態平衡 ，b）調整宿主的微生態失調， c）兼有若幹其他保健功能
分類：a）益生菌著眼於活的有益菌，b）益生素著眼於益菌代謝物
c）合生劑兼a+b
微生態學
曆史：1977年德國學者Volker Rush提出
定義：是微觀層次的生態學科（細胞與分子）
任務：a）研究正常菌群的本質及其與宿主相互關係，b）闡明微生態平衡和失調的機製，c）指導研製微生態製劑；調整微生態平衡
2. 共生類型
微生物間的共生實例：地衣為菌、藻（即子囊菌與綠藻或籃細菌）奧氏甲烷芽孢杆菌（產氫產乙酸菌與產甲烷菌）
微生物與植物間的共生實例：根瘤菌與豆科植物間共生之典型
微生物與動物間的共生實例：反芻動物瘤胃微生物的共生也十分典型
生理上的共生：共生菌從基質中吸收水分和無機養料；共生藻進行光合作用，合成有機物。
結構上的共生：形成有固定形態的葉狀結構。
3. 寄生類型
微生物間的寄生、微生物與植物的寄生、微生物與動物的寄生
4. 拮抗
概念：生物產生的代謝產物抑製它種生物生長發育甚至將後者殺死。是指微生物間的“化學戰術”
實例：抗生菌產生抗生素抑製其它生物生長發育
廣義：因某種微生物的生長而引起的其它條件的改變（例如缺氧、pH改變等），從而抑製它種生物的現象也稱拮抗。
5. 捕食
捕食：是指一種較大型生物直接捕捉、吞食另一種小型生物以滿足其營養需要的相互關係。
微生物間捕食：原生動物吞含細菌和藻類的現象
意義：汙水淨化和生態係統的食物鏈
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