在酸性環境中，還生活著一些嗜酸嗜熱的芽孢杆菌（Bacillus），在60～65℃、pH3～4的條件下，生長速率達到最大。這種細菌能利用碳水化合物或氨基酸作為營養源。在酸熱環境中生長繁殖的一種最異常的微生物是嗜酸熱原體（Thermoplasma acidophilum），它的最適生長溫度為59℃，最適pH為2左右，無細胞壁，對營養要求相當複雜，必需利用酵母膏作為營養基質，但必須有天然的有機營養才能生長。
此外，在酸性環境中，還生活著許多嗜酸的真核微生物，如橢圓酵母、紅酵母等。有一種頭孢黴（Cephalosporium），能在濃度為10%以上的硫酸中生長，並要求培養基中含有4%的硫酸銅，它是迄今發現的抗酸能力最強的微生物。多年來，一些嗜酸細菌被廣泛用於銅等金屬的細菌浸出。
另外，人們也在嚐試利用硫杆菌分解磷礦粉，通過提高其溶解度來增加磷礦粉的肥效。過提高其溶解度來增加磷礦粉的肥效。
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