衣原體是一類在真核細胞內專營寄生生活的微生物。研究發現這類微生物具有和革蘭氏陰性細菌很多相似。這些特性是：
（1）有DNA和RNA兩種類型的核酸；
（2）具有獨特的發育周期，類似細菌的二分裂方式繁殖；
（3）具有粘肽組成的細胞壁；
（4）含有核糖體；
（5）具有獨立的酶係統，能分解葡萄糖釋放CO2，有些還能合成葉酸鹽，但缺乏產生代謝能量的作用，必須依靠宿主細胞的代謝中間產物，因而表現嚴格的細胞內寄生；
（6）對許多抗生素、磺胺敏感，能抑製生長。
已知的與人類疾病有關的衣原體有三種，分別是鸚鵡熱衣原體、沙眼衣原體和肺炎衣原體。這三種衣原體均可引起肺部感染。
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