針對真菌的共同序列而設計的‘全能引物’（pan-primer）而擴增580bp的產物，為真菌所共有。檢測血液標本即可明確體內有無真菌感染。
（二）用於真菌的型別分析。國內應用隨機引物PCR擴增後進行真菌分型，結果可靠。應用隨機引物擴增物多態性分析（RAPD）可以將5種曲黴菌鑒別開（煙、黃、黑、土、構巢曲黴）。國外結合PCR與酶標記探針在紙條上進行檢測（LiPA,lineprobeassay）可鑒別出主要的致病性真菌。
（三）檢出念珠菌的基因變異快速確定念珠菌對酮康唑的耐藥性。此種耐藥性由基因的1554T突變為C而致，應用Lightcycler儀器，以熒光共振能量轉移和基因片段溶解溫度曲線技術測定。
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