金黃色葡萄球菌是人類化膿感染中最常見的病原菌，可引起局部化膿感染，也 可引起肺炎、偽膜性腸炎、心包炎等，甚至賬血症、膿毒症等全身感染。近年來，由金黃色葡萄球菌引起的食物中毒越來越多，在美國，由金黃色葡萄球菌引起的感染占第二位，僅次於大腸杆菌。
流行病學分型技術：
血清學分型：絕大多數金黃色葡萄球菌含A型多糖抗原，漿凝固酶陰性的菌株 含B型多糖抗原，而致病與非致病的菌株均含有C型多糖抗原。
噬菌體分型：根據國際小組第6次會議通過的金黃色葡萄球菌噬菌體分為4個群23個型，生產腸毒素引起食源性疾病的菌株主要是Ⅲ群與Ⅳ群。
腸毒素分型：將分離獲得的菌株使用產毒培養基，采用透析膜培養方法進行產毒培養，並將獲得的培養液進行濃縮提純後可用下列不同方法進行腸毒素的測定。參見孟昭赫《食品衛生檢驗方法注解》微生物部分。
脈衝場電泳（PFGE）分子分型：Hennekinne等（2003年）對73株不同來源的金黃色葡萄球菌（屬於八個生物型），進行Smal-PFGE分型，結果有61個PFGE分型模式。PFGE對辨別金黃色葡萄球菌是有效的，並且比生化分型法有更強的辨別力。
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