室內質控是室間質控的基礎，而室間質控是對室內質控的驗證，質量是臨床微生物實驗室的生命。在新發感染性疾病（emerging infectious disease）不斷發生的形勢下，臨床微生物室的檢驗質量保證尤其重要。
（一）建立標本接種前的質量控製製度
沒有好質量的標本，實驗室采取任何先進的分離、鑒定和藥敏技術都是無濟於事的。建議成立由醫生、護士和細菌室參與的監督責任程序，對不同的標本規定不同的接種時間範圍，如：痰標本應規定在留取標本後1 小時內送至實驗室，細菌室應在收到標本後30分鍾內接種完畢；糞便標本應采集後立即接種；血液標本種入培養血瓶後立即送檢或於室溫下保存，切不能放冰箱；尿標本應於2 小時內送實驗室，實驗室收到標本後應於30分鍾內接種完；拭子標本采集後應全部采用輸送培養基送到實驗室檢查。
（二）建立細菌分離率質控係統
呼吸道標本或可能含嗜血杆菌的標本一定要接種巧克力培養基；含5%脫纖維綿羊血瓊脂；采用5%-10%的CO2培養係統；培養周期24~72 h。
考察指標：嗜血杆菌屬在常規送檢標本中的分離率應不低於30%~50%；肺炎鏈球菌的分離率不低於5%~10%；卡他莫拉菌的分離率不低於2%~5%。如果在1周中未分離出上述苛養菌應認真查找原因。
（三）藥敏質控係統的規範化
質控的抗菌藥物種類應包括全部常用抗菌藥物；正確選擇質控菌株，如金黃色葡萄球菌ATCC25923 用於紙片法藥敏的質控，而金葡菌ATCC29213用於稀釋法藥敏質控；建立3種係統藥敏質控：30 d初始質控，在30 d內失控不超過3次時可進入1周質控。如失控超過3次應進入5 d的糾控係統，經5 d糾控，合格後方可進入1周質控。1周質控是維持日常質控的形式，一旦失控應進入糾控係統，按糾控規則處理。
（四）鑒定質控係統
包括自動化設備鑒定係統、商品鑒定係統如API、單一的生化反應管及原材料，原則上應進行每換批號時都要有質控這也稱為批批檢。特別容易被忽略的是羊血的質量，如羊血中是否含抑製細菌生長的物質；M—H瓊脂中胸腺嘧啶含量。可通過平皿抑製試驗檢測羊血是否含抗生素，在塗有細菌的平皿不同方位滴入羊血數滴，35℃培養過夜觀察結果。要求在滴有羊血的部位不出現抑菌環；用糞腸球菌ATCC29212 或ATCC33186質控菌株測試MH瓊脂上氨苄西林的抑菌環，若產生20mm或更大的抑菌環，表示合格。
（五）質控記錄
要真實，要有失控（超過質控允許範圍的結果稱為失控）記錄，並認真的尋找原因和解決問題。
（六）質量控製應該是每個有發報告檢驗人員的職責，不要把質控工作讓一個人去做，在實驗室要樹立質量意識。
（七）室間質量控製
二級或以下醫院應參加本地區或本市的質量控製活動；三級醫院除參加本地區的質控活動外還應該參加全國或全球的質量控製活動。
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