嗜鹽微生物包括嗜鹽菌和耐鹽菌。
嗜鹽菌是指那些能耐受一定濃度的鹽溶液，但在無鹽存在條件生得最好的菌類，入金黃色葡萄球菌。嗜鹽菌專指那些一定濃度的鹽為菌體生長所必需，且隻有在一定濃度的鹽溶液中才生長最好的菌類。後者依嗜鹽濃度不同，可又分為輕度嗜鹽菌（最適鹽濃度為0.2～0.5mol/L），中度嗜鹽菌（最適鹽濃度0.5～2.0mol/L）和極端嗜鹽菌（最適鹽濃度>3mol/L），其中部分極端嗜鹽菌是為嗜鹽菌古細菌。
高鹽環境
高鹽環境遍及世界，主要是鹽湖，鹽場、鹽礦。這些高鹽環境看上去條件嚴酷，但仍能成為一個高鹽生態係統。其中活躍一些極端嗜鹽微生物和嗜鹽藻類，如杜氏藻嗜鹽微生物在分類上包括8個屬：鹽杆菌屬、鹽球菌屬、富鹽菌屬、鹽深紅菌屬、嗜鹽堿杆菌屬、嗜鹽堿球菌屬和Halbaculum等。
嗜鹽菌常出現在高鹽食物中，如醃魚、海魚和鹹肉。這些嗜鹽菌生長，除了不太美觀以外，還可能帶來一些不良後果，甚至是嚴重後果。已報道能在鹹魚中生長的嗜鹽菌有鹽沼鹽杆菌、鱘魚鹽球菌。近年來，我國陸續從進口鹹魚中、海魚中分離出嗜鹽性弧。有關鹹魚中毒事件也有時發生。
在高鹽發酵環境中，嗜鹽菌活動是十分重要的。如醬油高鹽稀態發酵階段，起主要作用的是嗜鹽性乳酸菌球菌和嗜鹽酵母。它們的代謝產物是醬油風味的主要來源。類似情形也發生在醃酸菜與醬醃菜發酵中。
應用前景
紫膜蛋白能夠通過構型改變儲存信息，並且有廣泛的pH和溫度耐受範圍，是未來之奧生物計算機芯片的理想材料。某些嗜鹽菌體內含有豐富的類胡蘿卜素、r—亞油酸等成分，可望用於並開發保健食品。嗜鹽菌的酶將是工業上耐鹽酶的重要來源。還有的嗜鹽菌在一定條件下能大量積累生物塑料，可用於可降解生物材料的開發。此外，在高鹽汙水處理方麵也將發揮重要作用。
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