單個微生物在適宜的固體培養基表麵或內部生長、繁殖到一定程度可以形成肉眼可見的、有一定形態結構的子細胞生長群體，稱為菌落（colony）。當固體培養基表麵眾多菌落連成一片時，便成為菌苔（lawn）。不同微生物在特定培養基上生長形成的菌落或菌苔一般都具有穩定的特征，可以成為對該微生物進行分類、鑒定的重要依據。大多數細菌、酵母菌、以及許多真菌和單細胞藻類能在固體培養基上形成孤立的菌落，采用適宜的平板分離法很容易得到純培養。所謂平板，即培養平板（culture plate）的簡稱，它是指固體培養基倒入無菌平皿，冷卻凝固後，盛固體培養基的平皿。這方法包括將單個微生物分離和固定在固體培養基表麵或裏麵。固體培養基用瓊脂或其它凝膠物質固化的培養基，每個孤立的活微生物體生長、繁殖形成菌落，形成的菌落便於移植。最常用的分離、培養微生物的固體培養基是瓊脂固體培養基平板。這種由Kock建立的采用平板分離微生物純培養的技術簡便易行，100多年來一直是各種菌種分離的最常用手段。
1. 稀釋倒平板法（pour plate method）
先將待分離的材料用無菌水作一係列的稀釋（如1:10、1:100、1:1,000、1:10,000......），然後分別取不同稀釋液少許，與已熔化並冷卻至50℃左右的瓊脂培養基混合，搖勻後，傾入滅過菌的培養皿中，待瓊脂凝固後，製成可能含菌的瓊脂平板，保溫培養一定時間即可出現菌落。如果稀釋得當，在平板表麵或瓊脂培養基中就可出現分散的單個菌落，這個菌落可能就是由一個細菌細胞繁殖形成的。隨後挑取該單個菌落，或重複以上操作數次，便可得到純培養。
2. 塗布平板法（spread plate method）
由於將含菌材料先加到還較燙的培養基中再倒平板易造成某些熱敏感菌的死亡，而且采用稀釋倒平板法也會使一些嚴格好氧菌因被固定在瓊脂中間缺乏氧氣而影響其生長，因此在微生物學研究中更常用的純種分離方法是塗布平板法。其做法是先將已熔化的培養基倒入無菌平皿，製成無菌平板，冷卻凝固後，將一定量的某一稀釋度的樣品懸液滴加在平板表麵，再用無菌玻璃塗棒將菌液均勻分散至整個平板表麵，經培養後挑取單個菌落。
3. 平板劃線法（streak plate method）
用接種環以無菌操作沾取少許待分離的材料，在無菌平板表麵進行平行劃線、扇形劃線或其他形式的連續劃線，微生物細胞數量將隨著劃線次數的增加而減少，並逐步分散開來，如果劃線適宜的話，微生物能一一分散，經培養後，可在平板表麵得到單菌落。
4. 稀釋搖管法（dilution shake culture method）
用固體培養基分離嚴格厭氧菌有它特殊的地方。如果該微生物暴露於空氣中不立即死亡，可以采用通常的方法製備平板，然後置放在封閉的容器中培養，容器中的氧氣可采用化學、物理或生物的方法清除。對於那些對氧氣更為敏感的厭氧性微生物，純培養的分離則可采用稀釋搖管培養法進行，它是稀釋倒平板法的一種變通形式* 。先將一係列盛無菌瓊脂培養基的試管加熱使瓊脂熔化後冷卻並保持在50℃左右，將待分離的材料用這些試管進行梯度稀釋，試管迅速搖動均勻，冷凝後，在瓊脂柱表麵傾倒一層滅菌液體石蠟和固體石蠟的混合物，將培養基和空氣隔開。培養後，菌落形成在瓊脂柱的中間。進行單菌落的挑取和移植，需先用一隻滅菌針將液體石蠟--石蠟蓋取出，再用一隻毛細管插入瓊脂和管壁之間，吹入無菌無氧氣體，將瓊脂柱吸出，置放在培養皿中，用無菌刀將瓊脂柱切成薄片進行觀察和菌落的移植。
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