一、目的
采用光敏生物素作光照標記則可以避免以上不足,本實驗利用長臂光敏生物素標記,由於克服了空間位阻,使檢測靈敏度成百倍地提高(其靈敏度已接近放射性同位素的水平)。
用長臂光敏生物素標記的核酸探針與固定在硝酸纖維膜(NC膜)上的樣品核酸分子進行斑點雜交,洗淨後用抗生物素-堿性磷酸酶複合物(AV-AP)作酶標,與底物BCIP+NBT顯色反應,即可觀察檢測結果。本實驗目的即采用這一方法標記病毒特異片段作為探針,以期在核酸分子水平上檢測特定的病毒。
二.實驗材料和用具
1.材料
作為模板用的病毒外殼蛋白基因DNA片段,待測大田樣品,陽性株、病毒或質粒。
2.試劑
長臂光敏生物素核酸探針標記和檢測試劑盒:購自華美生物製品公司(軍事醫學科學院放射醫學研究所生產)
硝酸纖維素膜(NC膜):Bio-rad公司產品,產品號162-0116
甲酰胺:Fluka公司產品
牛血清白蛋白(BSA):北京紅星生物化學製品廠產品
普通化學藥品由國內各化學試劑廠生產
三.實驗步驟
1.光敏生物素標記GFV-cDNA探針於暗室中,將製備的待標記病毒-cDNA(0.5-1.0ug/ul,無用Tris溶解)定量加入小離心管中,加入等體積至倍量的光敏生物素溶液(1 μl/ μl),充分混勻。將小離心管插入冰浴盒中,開啟光標記燈(250W汞燈)燈頭距液麵10cm,光照20-25min。光標完畢,反應液為紅褐色,加dH2O至總體積為100 μl ,加入100 μl仲丁醇,振蕩混勻,離心1min,小心吸去上層丁醇相,再如上重複加仲丁醇萃取一次,吸去仲丁醇。仲丁醇提取2次後,水相體積應減少至40 μl,水相呈淡紅色。在此液中,加入5 μl3MNaAc充分混勻,加100 μl冷無水乙醇,置於-20℃過夜。4℃離心15min。棄上清,用冷80%乙醇洗一次。沉澱真空幹燥。沉澱溶於少量ddH2O,配製成母液。-20℃保存,用時稀釋。
2.核酸斑點雜交
樣品的製備:參見前麵關於病毒RNA、總RNA的提取。樣品在斑點雜交前先經熱變性處理。
膜的處理:NC膜用2XSSC溶液濕潤均勻,放在濾紙上,37℃晾幹。
點樣:用Tip頭吸取樣液1-5 μl ,分多次點樣於NC膜上一點,使斑點盡可能的小,同時NC膜上要作記號。
烘幹:放於一鋪有潔淨濾紙的培養皿中,80℃烘烤2小時。
配備預雜交液和雜交液:(每cm2 膜用80 μl的量,以下為5 ×10cm2用4ml)。
3:用前煮沸10min變性,速置冰水中冷卻,再加入。
預雜交:將雜交條放入小管中,加入預雜交液2ml,42℃搖動2-4h。
雜交:將雜交條換入另一小管中,加入雜交液2ml,42℃搖動20-24h。
洗滌:將膜取出,放入平皿中,用雜交洗滌液A :2 ×SSC,加0.1%SDS洗三次,每次5min,室溫加振蕩。
將膜放於三角瓶中,用雜交洗滌液B :0.1 ×SSC,加0.1%SDS65℃振蕩洗三次,每次5min。輕輕吸幹濾膜,放入另一皿中,準備顯色。
4.顯色
封閉:用2ml3%BSA封閉液(3gBSA溶於70mldH2O中,用濃HCl調pH至3.0,煮沸20min 後,冷至室溫,用 10mMNaOH 調pH 至7.5 ,加入10ml 緩衝液: 1MTris- HClpH7.520mMMgCl2 ,0.05%(V/V)TritonX-100 ,5.8gNaCl 。加水至100ml),42 ℃封閉2-4h 以上(封閉液在4℃保存可重複使用3次,5 ×10cm2膜使用4ml)。
酶聯:將膜取出,放入2ml抗生物素蛋白AV與AP酶偶聯複合體溶液中,室溫避光保溫15min ,輕輕振蕩。AV-AP 液:緩衝液:100mMTris-ClpH7.5 ,1.0MNaCl ,2mMMgCl2,0.05%(V/V)TritonX-100。4ml緩衝液內加入AV-AP8-16U,適合5 ×10cm2膜的用量。AV-AP溶液在4℃保存可反複使用多次。
洗滌:用洗滌液A ,B 各洗三次,每次5min 。顯色洗滌液A :100mMTris-ClpH7.5,1.0MNaCl,2mMMgCl2 ,0.05%(V/V)TritonX-100 。顯色洗滌液B:0.1mMTris-ClpH7.5,0.5MNaCl,0.5%Tween-20。
顯色:將膜放入另一管子中,加入新配製的底物溶液2ml ,再加入BCIP(1)10 μl,NBT(2)10 μl,避光放置。顯色數分鍾至數小時。陽性結果為出現蘭紫色斑點。本底未出現前即可傾出顯色液終止。
底物溶液:100mMTris-ClpH9.5,100mMNaCl,5mMMgCl2 。(1)BCIP10mg溶於200 μl 甲酰胺中。(2)NBT15mg溶於200 μl70% 甲酰胺中。此二液均可在-20℃保存。
終止反應:用終止液(10mMTris-ClpH7.5,1.0mMEDTA)洗一次,dH2O衝洗淨,封存於聚乙烯袋中,避光保存。選擇膜濕潤狀態拍攝結果。