本規範由微生物菌種資源平台建設項目提出。
本規範起草單位:中國農業科學院土壤肥料研究所、中國科學院微生物所、中國林業科學研究院森林保護研究所、中國藥品生物製品檢定所、中國醫學科學院醫藥生物技術研究所、中國獸醫藥品監察所、中國食品發酵工業研究院。
本規範主要起草人:葉強、薑瑞波、顧金剛、周宇光、樸春根、張月琴、陳敏、程池等。
支原體(Mycoplasma)是目前所能發現的能在無生命培養基中生長繁殖的最小的微生物。是一類無細胞壁的原核細胞型微生物,由於其能形成有分枝的長絲,故被稱之為支原體。支原體能導致人類和動物、植物疾病。
支原體菌種資源是微生物菌種資源的重要組成部分,與其他微生物菌種資源有著相似的共性描述內容,又具其特殊性。本規範根據當前國家自然科技資源平台建設的總體要求,結合支原體菌種資源的特點而製定,以實現支原體菌種資源描述信息的規範化,有利於支原體菌種資源的收集、保存、鑒定、評價、研究和利用,科學整理菌種資源,促進菌種資源信息化,實現菌種資源的高效共享和可持續利用。
1 範圍
本標準規定了支原體菌種資源的描述內容、描述要求。
本標準適用於支原體菌種資源的收集、整理和保存及數據庫和信息共享網絡係統的建立。
2 規範性引用文件
下列文件中的條款通過本規範的引用而成為本規範的條款。凡是注明日期的引用文件,其隨後所有的修改單(不包括勘誤的內容)或修訂版均不適用於本規範,然而,鼓勵根據本規範達成協議的各方研究是否可以使用這些文件的最新版本。凡是不注明日期的引用文件,其最新版本適用於本規範。
GB 19489-2004 實驗室 生物安全通用要求
國務院令第424號發布《病原微生物實驗室生物安全管理條例》
科技部自然科技資源平台聯合管理辦公室文件《自然科技資源共性描述規範(試行)》
3 術語、定義、符號、縮寫語
1.2
支原體 Mycoplasma
是目前所能發現的能在無生命培養基中生長繁殖的最小的微生物。是一類無細胞壁的原核細胞型微生物。支原體屬於軟壁菌門(Tenericutes)、柔膜體綱(Mollicute)、支原體目(Mycoplasmatales)、支原體科(Mycoplasmataceae)、支原體屬。現知有64個種。 對人致病的主要為肺炎支原體(M.pneumoniae)、人型支原體(M.hominis)和生殖器支原體(M.genitalium)。廣義的支原體還包括支原體科脲原體屬的解脲脲原體(Ureaplasma urealyticum)。
1.3
支原體菌種資源 Mycoplasma culture collections
是指經妥善保藏管理的支原體菌種實物及其相關信息
4 要求
4.1 對菌株的描述條款應明確而無歧義,並且:
描述內容應清楚、準確、力求完整;
要充分考慮菌株的最新研究進展;
能被微生物專業人員理解。
4.2 描述要素
描述要素分為2類
5 M:必備要素,必須描述的要素。
6 O:可選要素,其描述與否視具體菌株而定。
7 描述內容
對於支原體菌種資源的描述應從資源基本信息、生態環境、形態學特征、培養特征、生理生化特性、細胞化學組分、遺傳學特性、功能特性等八個方麵進行描述。數量性狀描述以計量單位表示,質量性狀描述符按評價規範和等級劃分表示。
5.1 基本信息
支原體在微生物分類學上的學名。
支原體的中文名稱。尚無中文譯名時,可暫時空缺。
國家自然科技資源平台資源分級歸類與編碼標準中的編碼。
支原體在保藏機構的保藏編號,由前綴和菌株編號兩部分組成。前綴,即保藏機構名稱的縮寫,前綴和株菌編號之間不留空格。
該支原體菌株在其他菌種保藏機構中的菌株保藏編號,有兩個以上編號時,中間用分號隔開。
描述衣原體的生物安全等級歸類:以生物安全一類、二類、三類、四類表示。
保藏機構收集、按一定的規範編號建立菌種檔案並保存該菌株的時間。以yyyy-mm-dd表示。
A.1 保藏單位得到該支原體菌株的途徑,轉移途徑以左指向箭頭連接。
支原體菌種資源提供人/單位的名稱。
支原體菌株的最初分離編號。
該支原體菌株的分離源,宜指明具體的分離物質和部位。
支原體菌種采集地所在國家或地區名稱。
分離采集地的行政區劃,詳細到縣。
采集分離的具體地點。
原始樣品的采集時間,用YYYY-MM-DD表示。
適合支原體生長的營養物質 (包括添加的血清) 的名稱及統一編號。
指適宜支原體菌株生長的溫度(以℃表示)、相對濕度、pH、厭氧和其它條件。
支原體在特定培養條件下,生長至成熟(穩定)所需要的時間,以h表示。
凡是模式菌株應予指明。
應指明每個菌株的界、門、綱、目、科、屬、種。
如需要,可指明該菌株的變種、亞種名稱等。
5.2 特征特性信息
—— 細胞形狀 (M)
描述支原體顯微鏡下所觀察到的形狀,如球形、絲狀、環狀、星狀、顆粒狀和螺旋狀等。
—— 細胞大小(M)
描述支原體細胞的大小,其大小其大小以直徑表示,單位為µm。
—— 莢膜(M)
描述支原體是否有莢膜。
—— 培養條件(M)
描述培養條件是否需要加入人或動物血清。
—— 固體培養基上菌落大小 (M)
描述支原體在固體培養基上的菌落大小,通常以直徑表示,單位為 mm。
—— 固體培養基上菌落形狀(M)
描述菌落是呈典型的呈荷包蛋樣(中心稠厚,四周半透明,並常深入培養基內),還是呈顆粒狀菌落。
—— 液體培養基中的渾濁度(M)
描述支原體在液體培養基中混濁度情況。
描述支原體能否利用葡萄糖;能否水解精氨酸;能否水解尿素;是否需要膽固醇;能否還原四氮唑;能否吸附紅細胞。
描述抗原分型基礎和所采用的方法及抗原分型結果。
支原體所含DNA和RNA的比值;支原體全部或部分基因序列;支原體基因組的堿基對數目,以kb表示。堿基鏈數目;堿基鏈存在方式 ;堿基鏈性質;開放閱讀框的數目和位置; G+Cmol%。
—— 核酸類型(M)
描述衣原體遺傳物質的核酸類型,DNA/RNA。
—— 核酸序列 (0)
描述衣原體全部或部分基因序列。
—— 基因組大小(O)
描述衣原體基因組的堿基對數目,以kb表示。
—— 堿基鏈數目(M)
描述衣原體堿基鏈的數目。
—— 堿基鏈存在方式 (M)
描述堿基鏈存在方式。
—— 堿基鏈性質(O)
描述堿基鏈的性質。
—— 開放閱讀框的數目和位置(O)
描述衣原體開放閱讀框的數目和位置。
—— G+Cmol%
描述衣原體G+Cmol% 含量。
—— 自然宿主
—— 感染致病性或毒性
描述衣原體的感染性或毒性。
—— 胞外穩定性
描述支原體胞外是否穩定。
—— 流行季節(O)
支原體所致疾病與季節的關係。
—— 傳播方式(M)
描述包括經飛沫、呼吸道傳播和直接(性)或間接接觸傳播等傳播方式。
—— 地理分布(O)
描述支原體所致疾病的地理分布。
—— 組織嗜性(M)
描述支原體的主要易感細胞和主要易感部位。
—— 對宿主致病的病理變化(O)
描述支原體對宿主致病的病理變化情況。
—— 對熱的抵抗力(0)
描述支原體對溫度的耐受程度
—— 消毒劑的敏感性(O)
描述支原體對消毒劑敏感的種類與敏感程度。
—— 對抗生素的敏感性(O)
描述支原體對抗生物敏感的種類與敏感程度。
描述支原體菌種的主要用途。包括分類學、分析檢測、經濟用途、環保、醫學、研究、教學等。
5.2 其它信息
保存支原體菌種資源采用的技術方法。包括液氮超低溫凍結、-80℃冰箱凍結、真空冷凍幹燥、礦物油斜麵、斜麵等。
支原體的顯微圖片。
與支原體菌種資源相關的資料信息,包括書籍、期刊、學術報告及其他。
參考文獻
參考文獻
[1] 陸德源等.醫學微生物學第五版. 北京:人民衛生出版社,2001
[2] 周德慶.微生物學教程. 北京:高等教育出版社,1993
[3] M.T.馬迪根,J.M.馬丁克,J.帕克.微生物生物學.楊文博等譯. 北京:科學出版社,2001
[4] M.J.小佩爾紮等.微生物學.武漢大學微生物學教研室譯.北京:科學出版社,1987
[5]武漢大學、複旦大學生物係微生物學教研室. 微生物學.人民教育出版社,1979
[6]中國科學院微生物研究所.菌種保藏手冊.北京:中國輕工業出版社,1980
[7]中國標準出版社第一編輯室.標準化工作導則、指南和編寫規則標準匯編.北京:中國標準出版社,2003
[8] 楊蘇聲.細菌分類學.北京:中國農業大學出版社,1997
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