致瀉性大腸埃希氏菌
致瀉性大腸埃希氏菌能使人類致病，監診表現主要為嚴重腹瀉，多數表現為敗血症。根據血清型別、毒力和所致臨床症狀可分為產腸毒素性大腸埃希氏菌（ETEC）、腸致病性大腸埃希氏菌（EPEC）、腸侵襲性大腸埃希氏菌（EIEC）、腸出血性大腸埃希氏菌（EHEC）以及腸粘附性大腸埃希氏菌（EAEC）五類。
1．常規分離鑒定技術：按照GB/T4789-2003方法進行
酶聯免疫法（ELISA）：應用O157：H7多克隆抗體包被酶標板，加入適當稀釋與處理的糞便標本後，再與過氧化物酶標記的抗O157：H7抗體結合，加底物顯色，此法可直接檢測糞便中O157：H7大腸埃希氏菌抗原，結果與細菌培養法一致。
免疫磁珠分離法（IMS）：用免疫磁分離法檢測牛糞便和食品標本的大腸杆菌O157：H7。可提高了大腸杆菌O157：H7感染病例的檢出率，與PCR符合率高。
2．快速酶觸反應：大腸埃希氏菌具β-葡萄糖醛酸酶，但以O157：H7為代表的腸出血性大腸埃希氏菌（EHEC）卻不具此酶。
毒素及毒力因子檢測：包括LT、ST、Hly、SLT、Stx、EaeA、VT、EAST等，過去多用動物或細胞培養測定，現可用其單抗以多種免疫學手段檢出，也可用基因探針技術或PCR等分子生物學技術檢測。同時檢測Hly和SLT基因，能快速檢測和鑒定EHEC菌株，並與EPEC區分開來。
基因探針和PCR技術：國內徐建煙根據溶血素hlyAB基因序列設計了鑒定EHEC的特異DNA探針，敏感性特異性達99%。Fortin將套式PCR技術和熒光探針技術相結合來檢測O157，該方法不僅可以鑒定與O157抗血清有交叉反應的菌株，而且靈敏度高，可檢測牛奶和蘋果汁中102CFU/ml，的細菌，如果先進行6h增菌，可檢測1CFU/ml的細菌。
基因芯片：Chizhikov將6個編碼大腸杆菌細菌抗原和毒力的特異基因探針（EaeA，SltI，SltII，FliC，RfbE，IpaH）點樣在玻片上，取多重PCR擴增產物與之雜交，用於同時檢測和鑒定食物中毒相關的腸道病原體，該芯片可同時檢測15種沙門菌、誌賀菌和大腸杆菌的毒力因子。
細胞粘附試驗：傳統的細胞粘附試驗是檢測EIEC的標準方法。方法為在24孔板的孔中圓形玻片上培養的HEP-2細胞單層，生長致50%；待檢菌以L肉湯培養，
3．分子流行病學分型方法
血清型分型技術：包括O、K、H、F四種抗原。O抗原共171種，其中162種與腹瀉有關，是分群的基礎。K抗原103種。從病人新分離的大腸埃希氏菌多有K抗原。根據耐熱性等不同，K抗原分為L、A、B三種，其中L、B不耐熱，有60種。F抗原至少有5種，與大腸埃希氏菌的粘附作用有關。血清型的表示方式可按O：K：H排列，例如O：K：H如O111：K58（B4）：H2；O：K如O8：K88；O：H如O168：H27。
脈衝場電泳（PFGE）分型：用核糖體分型和脈衝腸電泳技術，對急性分泌型腹瀉病人中分離的ETEC病原菌分析，血清型相同的ETEC菌株具有遺傳異質性，不同血清型的ETEC菌株其PFEG型一致。美國國家公共衛生實驗室已完成了PFGE的標準化流程的製定。
隨機引物擴增DNA多態性（RAPD）和擴增片段長度多態性（FAFLP）分析分型技術：用隨機擴增多態性DNA技術（RAPD）分析，發現具有相同表型特征的ETEC菌株，用分子生物學分型方法能揭示菌株間的差異，這些差異往往在不能在對ETEC的表型中顯示出來。有學者認為FAFLP比PFGE具有更高的鑒定能力，擴增片段可精確到±1bp。
噬菌體分型：目前，通過對噬菌體感受性的不同，已獲得80餘種噬菌體型。
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