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菌落PCR的方法



錄入時間:2011-6-21 13:49:29 來源:互聯網

1 最簡單的:用槍尖或者牙簽從平板或液體中沾少量菌(多了就會影響反應了,沾上點就夠了),直接加入到PCR體係中反應就行了,依靠變性溫度來破裂細菌釋放DNA。
2 其它方法:用槍尖或者牙簽沾少量菌,加入到沒有加酶的PCR反應體係中,沸水浴5min,冷卻後加入酶,開始反應,有些不容易加熱破裂的菌預先煮沸一下,可以釋放更多的DNA,有利於PCR反應。
3 用Chelex,一些實驗室做菌種鑒定的時候習慣用的方法:可以去除一部分雜質,降低PCR反應所受的幹擾。
1) 5%-10%chelex 50μl(配法:5-10g chelex 加入100ml TE)+菌苔,在管壁適當研磨,震蕩混勻,短暫離心
2) 煮沸:細菌5min,放線菌10-15min
3) 冷卻至室溫,10000-12000rpm離心5-8min,取上清擴增
注:chelex方法適於細菌、放線菌,chelex提前在65攝氏度水浴中預熱,溶液有細小顆粒,吸取時槍尖最好先剪掉,否則不好吸。
 
這3個方法由簡到繁,效果當然是依次提高了。這樣的直接以細菌為模板進行PCR反應,特別是前兩種,適用於大量的篩選和驗證,由於加入了細菌本身的其他物質以及難免引入的培養基成分,可能會對PCR反應造成幹擾,假陽性假陰性都是可能出現的,所以之後最好還要進一步驗證。chelex方法可以去除一定的雜質,幹擾較小,但是畢竟也不如直接以DNA為模板效果好。實驗者可以根據自己的實際需要來選擇合適的方法。

 

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