1、根土比根土比是指單位植物根際土壤中微生物數量與鄰近單位根外土壤中微生物數量之比。
2、植物病原微生物是指那些寄生或附生於植物根係、莖杆、葉麵而從植物細胞中獲得營養物質、水分，導致植物發生病害甚至死亡的微生物。
3、VA菌根是內生菌根的主要類型，是由於菌根菌絲在根皮層細胞內形成特殊的變態結構泡囊（Vesicule)和叢枝(Arbuscule),而用其英文打頭字母得名。
4、內生菌根：在真菌與植物根係形成的菌根中真菌菌絲可以穿透根表皮層，進入皮層細胞間隙或細胞內，也有部分真菌菌絲可穿過菌根的表皮生長到根外，有助於擴大根的吸收，但主要是在皮層細胞間縱向延伸，或盤曲於皮層細胞內。這種菌根稱為內生菌根。
5、外生菌根：是指菌根菌菌絲在植物根表麵生長並交織成鞘套包在根外。鞘套外層菌絲結構疏鬆，並向外延伸使表麵呈氈狀或絨毛狀，並代替根毛起吸收作用。內層菌絲可進入根皮層細胞間隙形成哈蒂氏網，但不進入皮層細胞內。
6、菌根菌：是指能與植物形成共生聯合體菌根的真菌 。
7、植物根際：是指在植物根係影響下的特殊生態環境，一般指距根表2mm以內的土壤範圍稱為根際。
8、植物根際微生物：是指處於植物根際這個特殊生態環境中的微生物區係。
9、微生物寄生：在微生物寄生關係中，凡被另一類微生物寄生於體表或體內，細胞物質被另一類微生物獲取為營養，最後發生病害甚至被裂解死亡的這一過程稱為微生物寄生。
10、微生物寄生物：在微生物之間的寄生關係中，凡寄生於另一類微生物體表或體內，並從另一類微生物細胞中獲取營養而生存的微生物，稱為微生物寄生物。
11、根瘤：是豆科植物與根瘤菌相互作用而形成的植物---------根瘤菌共生體，具有固氮作用的特殊結構。
12、微生物之間的接力關係：是指微生物在分解複雜大分子有機物質時需要有多種微生物協同完成，在這個過程中，乙種微生物以甲種微生物代謝產物為營養基質，而丙種微生物又以乙種微生物的代謝產物為營養基質，如此下去，直至徹底分解，這種微生物之間的關係稱為接力關係
13、微生物之間的捕食關係：是一種微生物吞食或消化另一種微生物的現象，如原生動物捕食細菌，放線菌和真菌孢子等。
14、微生物之間的共生關係：是兩種微生物緊密地結合在一起，形成特定結構的共生體，兩者絕對互為有利，生理上發生一定的分工，且具有高度專一性，其他微生物種一般不能代替共生體中的任何成員。且分開後難以獨立生活，但不排除在另一生境中獨立生活。
15、微生物之間的互利共棲關係：是指在同一個環境中兩個微生物類群共棲時，雙方在營養提供或環境條件方麵都得益的關係。
16、微生物之間的偏利互生關係：這種關係是指在一個生態係統中的兩個微生物類群共棲，一個群體得益，而另一個群體既不得益也不受害的情況。
17、微生物之間的寄生關係：是指一種微生物生活在另一種微生物的表麵或體內，並從後一種微生物的細胞中獲取營養而生存，常導致後一種微生物發生病害或死亡的現象。
18、微生物之間的拮抗關係：是兩種微生物生活在一起時，一種微生物產生某種特殊的代謝產物或改變環境條件，從而抑製甚至殺死另一種微生物的現象。
19、微生物之間的競爭關係：是指兩個或多個微生物種群生活於同一環境中時，競爭同一基質，或同一環境因子或空間而發生的其中一方或兩方的群體大小或生長速率受到限製的現象。
20、土壤微生物生物量：是指單位土壤(m3或kg)中微生物細胞的重量。
21、微生物生態係：即是在某種特定的生態環境條件下，微生物的類群、數量和分布特征，以及參與整個生態係中能量流動和生物地球化學循環的過程和強度的體係。
22、發酵性微生物區係：是指土壤中那些對新鮮有機質很敏感，在有新鮮有機質存在時，可爆發性地旺盛發育，而在新鮮有機質消失後又很快消退的微生物區係，其數量變幅很大。
23、土著性微生物區係：是指土壤中那些對新鮮有機物質不很敏感，常年維持在某一水平上，即使由於有機物質的加入或溫度、濕度變化而引起的數量變化，其變化幅度也較小的微生物類群。
24、清水型水生微生物：主要是指那些能生長於有機物質不豐富的清水中的化能自養型和光能自養型的微生物，如硫細菌、鐵細菌、藍細菌等。
25、腐生型水生微生物：是指那些能利用進入水域的腐敗有機殘體、動物和人類排泄物，生活汙水和工業有機廢水為營養，轉化這些有機物為無機態物，使水質淨化變清，而微生物本身得到大量繁殖的一類微生物。
26、土壤微生物區係：是指在某種特定的環境和生態條件下的土壤中存在的微生物種類、數量以及參與物質循環的代謝活動強度。
27、土壤微生物區係分析：采用多種培養基和培養方法，培養土壤中微生物區係的各個組成成分，從而認識特定土壤中的微生物區係在數量上和類群上的特點，即為土壤微生物區係分析。
28、極端環境微生物：能生存於極端環境如高溫、低溫、高酸、高堿、高壓、高鹽等環境中的微生物。
29、微生物生態學：就是研究處於環境中的微生物和與微生物生命活動相關的物理、化學和生物等環境條件，以及它們之間的相互關係的科學。
30、生態學：是研究生物有機體與其棲居環境相互關係的科學。
31、水體的富營養化：是指水體中氮、磷元素等營養物的大量增加，遠遠超過通常的含量，結果導致原有生態係統的破壞，使藻類和某些細菌的數量激增，其他生物種類減少。
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