紫外燈
生物安全櫃中不需要紫外燈。如果使用紫外燈的話，應該每周進行清潔，以除去可能影響其殺菌效果的灰塵和汙垢。在安全櫃重新認證時，要檢查紫外線的強度，以確保有適當的光發射量。房間中有人時一定要關閉紫外燈，以保護眼睛和皮膚，避免因不慎暴露而造成傷害。
明火
在生物安全櫃內所形成的幾乎沒有微生物的環境中，應避免使用明火。使用明火會對氣流產生影響，並且在處理揮發性物品和易燃物品時，也易造成危險。在對接種環進行滅菌時，可以使用微型燃燒器或電爐，而不應使用明火。
溢出
實驗室中要張貼如何處理溢出物的實驗室操作規則，每一位使用實驗室的成員都要閱讀並理解這些規程。一旦在生物安全櫃中發生有生物學危害的物品溢出時，應在安全櫃處於工作狀態下立即進行清理。要使用有效的消毒劑，並在處理過程中盡可能減少氣溶膠的生成。所有接觸溢出物品的材料都要進行消毒和／或高壓滅菌。
認證
在安裝時以及每隔一定時間以後，應由有資質的專業人員按照生產商的說明對每一台生物安全櫃的運行性能以及完整性進行認證，以檢查其是否符合國家及國際的性能標準。安全櫃防護效果的評估應該包括對安全櫃的完整性、HEPA過濾器的泄漏、向下氣流的速度、正麵氣流的速度、負壓／換氣次數、氣流的煙霧模式以及警報和互鎖係統進行測試。還可以選擇進行漏電、光照度、紫外線強度、噪聲水平以及振動性的測試。在進行這些測試時，檢測人員要經過專門的培訓，采用專門的技術和儀器設備。強烈建議由有資質的專業人員來進行測試。
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