處理生物安全危害時，使用安全設施並結合規範的操作將有助於降低危險。
實驗室主任應谘詢生物安全官員和安全委員會（如果有），確保配備足量的設備，並能正確使用。選擇設備時應符合一些基本原則，即：
1、在設計上應能阻止或限製操作人員與感染性物質間的接觸
2、建築材料應防水、耐腐蝕並符合結構要求
3、設備裝配後應無毛刺、銳角以及易鬆動的部件
4、設備的設計、建造與安裝應便於操作、易於維護、清潔、清除汙染和進行質量檢驗。應盡量避免使用玻璃及其他易碎的物品。
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