一、微生物學檢查
（一）標本
取糞便標本應挑取糞便的膿血或黏液部分，避免與尿液混合。應在使用抗生素之前采樣，標本應新鮮，若不能及時送檢，宜將標本保存於30%甘油緩衝鹽水或專門運送培養基內。中毒性痢疾患者可取肛拭子。
（二）分離培養與鑒定
將標本接種於腸道鑒別或選擇培養基上，37℃孵育18—24h。挑取無色透明可疑菌落做生化反應和血清學試驗，以確定其菌群（種）和菌型。
（三）毒力試驗
測定誌賀菌的侵襲力可用Sennery試驗。係將受試菌18—24h的固體培養物，以生理鹽水製成9億/ml菌懸液，接種於豚鼠眼結膜囊內。若發生角膜結膜炎，則Sennery試驗陽性，表明受試菌有侵襲力。測定誌賀菌的ST，可用Hela細胞或Vero細胞，也可用PCR技術直接檢測其產毒基因stxA、stxB。
（四）快速診斷法
1、免疫染色法將糞便標本與誌賀菌抗血清混勻，在光鏡下觀察有無凝集現象。
2、免疫熒光菌球法：將標本接種於含有熒光素標記的誌賀菌免疫血清液體培養基中，37℃孵育4—8h。若標本中含有相應型別的誌賀菌存在，則生長繁殖後與熒光抗體凝集成小球，在熒光顯微鏡下易被檢出。
3、協同凝集試驗：以誌賀菌lgG抗體與Gowan葡萄球菌結合成為試劑，用來檢測病人糞便中有無誌賀菌可溶性抗原。
4、膠乳凝集試驗用誌賀菌抗血清致敏膠乳，使與糞便中的誌賀菌抗原起凝集反應。也可用誌賀菌抗原致敏膠乳，來檢測糞便中有無誌賀茵抗體。
5、分子生物學方法：用PCR技術、基因探針檢測1.40MDa的大質粒等。
二、防治原則
非特異性防治措施包括：水、食物和牛奶的衛生學監測，垃圾處理和滅蠅；隔離病人和消毒排泄物；檢測發現亞臨床病例和帶菌者，特別是飲食從業人員；抗生素治療感染個體。
誌賀菌的免疫防禦機製主要依靠腸黏膜表麵的slgA，而slgA需由活菌作用於黏膜局部才能誘發。因此，目前致力於活疫苗的研究。主要分為3類，即減毒突變株、用不同載體菌構建的雜交株以及營養缺陷減毒株。例如，鏈黴素依賴株活疫苗是一種減毒突變株；環境中存在有鏈黴素時始能生長繁殖。將其製成活疫苗給誌願者口服後因正常人體內不存在鏈黴素，該sd株不能生長繁殖，但也不立即死亡，尚可有一定程度的侵襲誌願者腸黏膜而激發局部免疫應答，產生slgA。同時，血清中的lgG、lgM特異抗體也增多。sd活疫苗的免疫保護具有特異性。 目前已能生產多價誌賀菌sd活疫苗。多種雜交株活疫苗也在研究之中。如將誌賀氏菌的大質粒導入另一弱毒或無毒菌中，形成二價減毒活疫苗。曾被選為研究對象的有宋內誌賀菌與傷寒沙門菌Ty2ia的雜交疫苗等。
治療誌賀菌感染的藥物頗多，但此菌很易出現多重耐藥菌株。同一菌株可對5-6種甚至更多藥物耐藥，給防治工作帶來很大困難。
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