細菌的大小是細菌基本的形態特征，也是細菌分類鑒定的依據之一。微生物大小的測定，需要在顯微鏡下借助於特殊的測量工具——測微尺，包括目鏡測微尺和鏡台測微尺。
目鏡測微尺是一塊可放入接目鏡內的圓形小玻片，其中央有精確的等分刻度，即將5mm長度刻成50等分或將10mm長度刻成100等分。測量時，需將其放在目鏡中的隔皈上（此處恰好與物鏡放大的中央物像重疊），用以測量經顯微鏡放大後的細胞物像。由於不同顯微鏡或不同的目鏡和物鏡組合放大倍數不同，目鏡測微尺每小格所代表的實際長度也不一樣。因此，用目鏡測微尺測量細菌大小時，必須先用鏡台測微尺進行校正，以求出該顯微鏡在一定放大倍數的目鏡和物鏡下，目鏡測微尺每小格所代表的相對長度。然後根據細菌細胞相當於目鏡測微尺的格數，再計算出細胞的實際大小。
鏡台測微尺是中央部分刻有精確等分線的載玻片，一般是將1mm等分為100等分，每格長0.01mm。鏡台測微尺並不直接用來測量細胞的大小，而是用於校正目鏡測微尺每格的相對長度。校正時，將鏡台測微尺放在載物台上，由於鏡台測微尺與細菌標本處於同一位置，都需經物鏡和目鏡的兩次放大成像進入視野，即鏡台測微尺隨著顯微鏡總放大倍數的放大而放大。因此從鏡台測微尺上得到的讀數就是細菌的真實大小，所以用鏡台測微尺的已知長度在一定放大倍數下校正目鏡測微尺，即可求出目鏡測微尺每格所代表的實際長度，然後移去鏡台測微尺，換上待測標本片，用校正好的目鏡測微尺在同樣放大倍數下測量細菌的大小。
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