②DNA—rRNA分子雜交：DNA中（G+C）mol%測定和DNA—DNA分子雜交方法為微生物種和屬的分類鑒定研究開辟了新的途徑，解決了以表型特征為依據所無法解決的一些疑難 問題。但是對許多屬以上的分類單元的正確關係仍不能解決。因為許多研究表明，當兩個菌株的DNA配對堿基少於20%時，DNA—DNA分子雜交往往不能形成雙鏈，因而限製了DNA—DNA分子雜交方法在微生物種 以上單元分類中的應用。要解決這個問題，就要研究RNA的堿基序列，需要用rRNA與DNA進行雜交。RNA是RNA轉錄的產物。在生物進化過程中，其堿基序列的變化比基因組要慢得多，保守得多，它甚至保留了古老祖先的一些堿基序列。因此，當兩個菌株的DNA—DNA雜交率很低或不能雜交時，用DNA—rRNA雜交仍可能出現較高的雜交率，因而可以用來進一步比較關係更遠的菌株之間的關係，進行屬和屬以上等級分類單元的分類 。DNA—rRNA雜交和DNA—DNA雜交的原理和方法基本相同，都是利用核酸複性的規律。但兩種方法也有差異：a。在DNA—rRNA分子雜交中，同位素標記部位在rRNA。
B.DNA—rRNA分子雜交結果是以Tm值來表示。Tm值越高，表示親緣關係越近。
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