1、根瘤菌肥料
根瘤菌肥料是含有大量活的根瘤菌細胞的生物製劑。它和豆科植物共生，進行生物固氮。
（1）根瘤菌
與相應的豆科植物共生固氮的根瘤菌很多，迄今為止已有100餘種，主要分布在根瘤菌屬、慢生根瘤菌屬、中華根瘤菌屬、固氮根瘤菌屬和中慢生根瘤菌屬內。有的根瘤菌隻能在種豆科植物根部結瘤，有的可在多種豆科植物中結瘤。
（2）根瘤菌肥料的生產
和固氮菌肥料生產相同，根瘤菌肥料也是采用液體通氣發酵法進行生產。產品也分液體菌劑和固體菌劑兩種。固體菌劑最為常用，它是用載體吸附發酵液製成的。常用的載體是草炭。
2、解磷微生物肥料
所謂解磷微生物肥料是指用解磷微生物作為菌種生產的、能使難溶性的磷酸鹽轉化為農作物易於吸收的磷素營養的生物製劑。
能分解難溶性的磷酸鹽的微生物主要有芽孢杆菌屬、假單胞菌屬、曲黴屬和青黴屬等屬中的一些種和氧化硫硫杆菌等目前一般認為這些解磷微生物在生長繁殖的新陳代謝過程中，能產生一些有機酸（如乳酸、檸檬酸等 ）和一些酶類（如植酸酶類等），使土壤中難溶性的無機磷酸鹽（如磷酸鐵、磷酸鉛）及有機磷酸鹽轉化成作物能夠吸收的可溶性磷。
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