1、 沼氣發酵中的微生物
沼氣發酵中的微生物都是厭氧和兼性厭氧微生物，主要包括分解有機物的微生物和產甲烷的微生物兩大類 。
分解有機物的微生物包括芽孢杆菌屬、假單胞菌屬和變形杆菌屬等微生物。產甲烷的微生物專性厭氧，不生孢子，範圍比較廣泛。迄今為止，已經分離鑒定的產甲烷微生物超過70種。
在分類學上，它們屬於古生菌。主要分布在甲烷杆菌屬、甲烷八疊球菌屬、甲烷球菌屬、甲烷螺菌屬和甲烷絲菌屬等19屬中。
2、沼氣發酵的原理
沼氣發酵是由混合的厭氧微生物利用有機碳化物發酵產生沼氣的發酵。整個發酵過程可分為3期：
1、液化期
沼氣發酵原料中的有機物質，被一些不產甲烷的微生物分解。纖維素、半纖維素、澱粉等分解為雙糖或單糖，蛋白質分解為多肽或氨基酸，脂肪分解為甘油和脂肪酸。
2、產酸期
產酸微生物分解糖類及澱粉類化合物，生成小分子揮發性的有機酸，如乙酸等。
3、產氣期
在嚴格厭氧條件下，產甲烷微生物利用小分子揮發性的有機酸轉化分解為CH4和CO2等氣體。
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