4、染料的降解
染料是能使其他物質獲得鮮明而堅實顏色的有機化合物。它的結構大部分都是芳香族化合物。它們在自然狀態下也難降解，有的還有致癌作用，既汙染環境，又危害人類健康。
微生物能在染料降解中起重要作用。 目前已經發現能降解染料的微生物種類很多，主要有真菌、細菌和藻類 。細菌中主要有磷酸鹽還原菌、硫酸鹽還原菌、芽孢杆菌科、反硝化菌屬、產堿杆菌屬、檸檬酸菌屬、腸道細菌屬等。它們能在厭氧環境下不完全降解染料。鏈黴菌和黃孢原毛平革菌能在有氧條件下，利用染料作為唯一碳源，進行降解，最終將礦化為CO2和H2O。
5、塑料的降解
塑料製品是人工合成的一類聚合物，應用十分廣泛。它在給人類帶來方便的同時，也產生了難以分解的“白色汙染”，在環境中長期存在而影響環境和人類健康。據報道，到目前為止，能強烈降解塑料的微生物不多，少數如曲黴屬等。它們通過3種方式，對合成塑料的生物降解有著重要作用：
①生物物理作用：微生物細胞的生長引起塑料製品的機械損失。
②生物化學作用：微生物的代謝產物作用於聚合物。
③酶的直接作用：微生物分泌的酶對聚合物內的某些組分起作用，引起氧化分解等。
除了尋找能分解塑料製品的微生物外，目前科學家正在研究開發可降解的無汙染塑料。其中一種方法就是用微生物生產可由微生物分解的新穎生物塑料，如英國科學家用真養產堿菌以CH2O、有機酸為原料，合成多羥酯，改變細菌環境條件，生產出一係列具有不同強度、柔性、韌性的生物多聚聚合物。東京工業大學學者改變培養基配方，能使產堿杆菌合成聚酯。
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