在抗生素分子結構中,經常可以見到各種糖結構單元,低聚糖和氨基環多醇類抗生素更是完全由糖的衍生物所構成。這些糖單元中,有些是非常常見的,如氨基葡萄糖及甘露糖等,有些則隻能在次級代謝產物中才能看到,具有特殊結構。
許多實驗事實已經證明抗生素中的糖單元一般直接從葡萄糖或其他常見的糖類轉化而來,不發生碳原子的重排。在初級代謝中,糖的相互轉化一般發生在其端部碳原子形成二磷酸核苷酯而活化後,在抗生素的糖苷合成中有時也能觀察到這種現象,下麵是一些具體例子。
碳黴糖(Mycarose)是存在於泰樂黴素和大環內酯類抗生素中的一種脫氧糖,其生物合成途徑中的兩種酶已經鑒別,其中第一種酶脫水酶將脫氧胸苷二磷酸(dTDP)-葡萄糖轉化為dTDP-4-酮-6-脫氧葡萄糖;第二種酶差向異構酶進一步將其轉化為dTDP-4-酮-L-鼠李糖,但以後的合成途經尚不清楚,圖10.4.7顯示了碳黴糖的合成途徑。鏈黴糖是鏈黴素的結構單元,其合成途徑的頭兩步反應與碳黴糖一樣,然後dTDP-4-酮-L-鼠李糖被重排為 dTDP-二氫鏈黴糖,在dTDP-二氫鏈黴糖裝配到抗生素分子上以後發生最終氧化為鏈黴糖的反應。鏈黴素中還含有甲基-L-氨基葡萄糖,是D-氨基葡萄糖的衍生物,合成途徑包括四個手性中心的轉化,但還不清楚具體的反應是怎樣進行的。
在有些氨基糖苷類抗生素中,鏈黴胍和2-脫氧鏈黴胺是必須的結構單元,雖然它們都從葡萄糖合成,而且結構上具有類似性,但合成途徑卻並不相同。鏈黴胍合成途徑的關鍵中間產物是D-myo-肌醇,而2-脫氧鏈黴胺的中間產物是2-脫氧-scyllo-肌糖。兩者的生物合成途徑都已經研究清楚。
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