對於漆酶在白腐菌降解木質素中的作用問題上有兩種不同的看法，一些研究者認為漆酶的作用很關鍵，它能參與許多溶木素必需的反應，能夠降解酚型木質素底物，在特殊條件下也能氧化非酚型木質素底物，而且隻要存在酚類物質或某些木素類底物，就能夠將Mn2+氧化為Mn3+螯合物，這些螯合物在木質素降解中起著重要的作用；另一些研究者的實驗卻表明漆酶和錳過氧化物酶單獨作用時都不能降解木質素，混合在一起卻能有效地起協同作用。也有一些研究者認為漆酶在降解木質素時幾乎不起作用，當微生物產漆酶的能力受到抑製時，對其降解木質素的能力沒有影響。事實上，木質纖維素是由纖維素、半纖維素和木質素組成的結構複雜的材料，各種木質纖維素的組成和結構存在著很大的差別，木質素的降解又是一個複雜的多酶體係共同作用的結果，不同的人得到不同的實驗結果是完全可以理解的。但是，無論如何，許多降解木質素的微生物都能產生漆酶這一現象說明，漆酶肯定以某種形式參與了降解過程。
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