氰細菌（又名藍綠藻，Cyanobacteriaceae）與其他類型的光養型細菌不同之處是它們在光合作用中甚至能利用水作為電子供體，最終產物是氧氣。紫色和綠色細菌不能進行產氧的光合作用，而需要在厭氧條件下才能光養生長，它們的電子供體的氧化還原勢比水還要低，如還原態的硫化物、氫或小的有機分子等。綠色光養型細菌分為兩類：綠菌科（Chlorobiaceae）和滑行絲狀綠色硫細菌（Chloroflexaceae），兩者都是硫細菌；紫色菌也分為兩類：紅硫菌科（Chromatiaceae）和紅螺菌科（Rhodospirillaceae）。氰細菌和Rhodospirillaceac利用硫化物或硫代硫酸鹽作為電子供體，但不會利用硫，而且在自然界中的數量比Chlorobiaceae和Chromatiaceae要少得多，對Chloroflexaceae的了解比較少，是一類綠色的、嗜熱的滑動菌。Chlorobiaceae和Chromatiaceae的差別表現在超微結構、細菌葉綠素和二氧化碳固定方式的不同。Chlorobiaceae還缺少Clavin循環。
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