許多反應中正磷酸既不是底物，也不是反應產物，但是催化該反應的酶仍有可能受到磷酸鹽的阻遏。與放線菌生產抗生素的代謝途徑中，有關的這類酶有：脫水四環素（ATC）氧化酶、p-氨基苯甲酸（PABA）合成酶和泰樂黴素發酵中的某些合成酶。
在S.aureofaciens中，ATC合成酶催化四環素合成途徑中最後第二個反應，這種酶在細胞內的比活對培養基中的磷酸鹽非常敏感，但經過提純的酶活卻不受磷酸鹽的影響，說明是細胞內這種酶的合成受到了磷酸鹽的阻遏而不是簡單的抑製作用。與殺假絲菌素合成有關的PABA合成酶也受到磷酸鹽的強烈阻遏，雖然磷酸鹽的存在會激發RNA合成，但與PABA合成酶有關的基因pabS卻受到了抑製。事實上已經鑒別出了pabS結構基因的啟動子，該啟動子受磷酸鹽調節。在S.fradiae發酵生產泰樂黴素的生物合成途徑中，已經發現至少有三種酶受到磷酸鹽的阻遏，值得一提的是催化泰樂黴素合成最後一步反應的大菌素（Macrocin）O-甲基轉移酶，該酶由基因tylF編碼，也受到磷酸鹽的阻遏。
在黴菌生產β-內酰胺類抗生素的合成途徑中也有一些酶受到磷酸鹽的阻遏，如頭孢菌素C合成途徑中的幾種酶，包括ACV合成酶、環化酶及擴展酶等都受到磷酸鹽的阻遏，而且磷酸鹽還起到了部分抑製酶活性的作用。
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