除了上麵討論的能夠生產抗生素的主要微生物種屬外,其他微生物也能夠產生一些重要的抗生素。在細菌中,從葡萄糖杆菌Gluconobacter SQ26445分離得到了磺胺淨素(Sulfazecin),屬幹磺酰基單環β內酰胺類抗生素。以後發現農杆菌(Agrobacterium)、色杆菌(Chromobacterium)、纖維黏細菌(Cytophage)和曲撓杆菌(Flexibacter)的一些種也能產生磺胺淨素。黃杆菌(Flavobacterium)和黃單胞菌(Zanthomonas)的某些菌株則能夠產生頭孢菌素C。
黴菌中的頭孢黴(Cephalosporium chrysogenum)是最重要的頭孢類抗生素生產菌種。頭孢黴在分類學上有一些不同看法,它們的共同特點是分生孢子的結構簡單,在一小部分分生孢子的頂上有一個單莖或分枝很少的莖,其菌絲分化形成節孢子。Cephalosporium chrysogenum的營養要求與青黴類似,一些糖類、甲基油酸或甘油都能作為碳源,無機氮、氨基酸或複合的多肽作為氮源。除頭孢類抗生素外,Cephalosporium生產的其他重要抗生素都屬於聚酮類或萜類化合物,如六酮類的淺藍菌素Cerulenin(C.caerulens)是脂肪酸生物合成的抑製劑;梭鏈孢酸(Fusidic acid,Acremonium fusidioides)則是抗葡萄球菌劑。
木黴屬的Trichoderma inflatum是環孢A的生產菌,環孢A具有抗黴菌活性,更重要的用途是作為器官移植的免疫抑製劑。
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