液體培養就是將微生物接種到液體培養基中進行培養，生產效率高，適於機械化和自動化，所以他是當前微生物發酵工業的主要生產方式。液體培養有靜置培養和通氣培養兩種類型。靜置培養適於厭氧菌發酵，如酒精、丙醇/丁醇、乳酸等發酵。通氣發酵適於好氧菌發酵，如抗生素、氨基酸、核苷酸等發酵。
（1）淺盤培養
容器中盛裝淺層液體靜止養，沒有通氣攪拌設備，全靠液體表麵與空氣接觸進行氧氣交換。這是最為原始的液體培養形式，勞動強度大，生產效率低，易汙染。早期的青黴素和檸檬酸發酵曾采用過淺盤培養。當時生產1kg青素就需要100萬個容積為1L的培養瓶。
（2）發酵罐深層培養
液體深層培養的主體設備是發酵罐。因在生產用的大多數微生物是好氧的，所以，好氧發酵的設備種類最多。常見的是機械攪拌發酵罐，又稱通用式或標準式發酵罐。發酵罐可以為微生物提供豐富而均勻的營養，良好的通氣攪拌，適宜的溫度和酸堿度，並能防止雜菌汙染。為此，發酵罐配備有培養基配製係統、蒸汽滅菌係統、空氣壓縮過濾係統和補料係統。液體深層培養是在青黴素等抗生素發酵中發展起來的技術。生產效率較高，易於控製，產品質量穩定，廣泛應用發酵工業中。但是，深層培養耗費的動力較多，設備較為複雜，需要較大的投資。
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