來源於酵母菌或其他微生物的蛋白稱為單細胞蛋白（SCP）。
酵母菌的蛋白含量可達幹重的50%，菌體蛋白與牛肉等蛋白的氨基酸組成基本相近，含一定量的必需氨基酸，營養價值很高，它是繼動物蛋白和植物蛋白之後的另一類重要的供人類和動物作營養的蛋白質來源。酵母菌的世代周期為2~9h，一個占地20m2的發酵罐一天生產的SCP蛋白質量相當於一頭牛。
利用石油餾分中的正烷烴、正烯烴和環烷烴等碳氫化合物作為生長源的酵母菌，可以使石油脫蠟，即除去石油中的正烷烴，降低其凝固點。尤其是假絲母菌屬既可用於脫蠟達到提高石油品質的目的，同時又可獲得豐富的SCP。
利用工業廢水。如熱帶假絲酵母可利用味精生產的廢水生產SCP，蛋白含量達60%，可作為動物飼料；產朊假絲酵母利用亞硫酸紙漿廢水生產SCP，這樣，既消耗掉了工業廢水等汙染物，治理了環境，同時又獲得了豐富的 SCP。
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