鞭毛具有運動功能，這是原核生物實現其趨性的最主要方式。
關於鞭毛運動的機製，最早存在“旋轉論”和“揮鞭論”兩個相互爭議的學說，最終由美國學者M.Silverman和M.Simon通過“拴菌”試驗證實了“旋轉論”的科學性。
“拴菌”試驗是一項運用逆向思維方式的巧妙設計，試驗如下：
利用抗體將單毛菌鞭毛的遊離端“拴”於載玻片上，再在光鏡下觀察該細胞，結果發現其隻能在載玻片上打轉並沒有出現伸縮“揮動”。由此肯定了“旋轉論”的合理性。
鞭毛菌的運動速度是非常高的，通常每秒20-80μｍ，最高能達到100μｍ。有些螺菌的鞭毛轉速每秒能高達40周，要比一般電動機的轉速更快。
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