在上一節我們分別論述了微生物學的發展對醫療保健、工業發展與農業生產的促進作用，除此之外，微生物學還在環境保護和生命科學領域發揮著關鍵作用，接下來我們分別展開敘述。
一、微生物學的發展對環境保護的促進作用
微生物在地球生態係統中處於分解者或還原者的地位，它是海洋和其他水體光合生產力的基礎，是食物鏈的關鍵環節，是汙水處理和生態農業的重要角色，是自然界元素循環的首要推動者。因此，微生物學是環境保護工程的重要學科支撐，微生物學工作者也在環境保護中起著無可替代的作用。
二、微生物學的發展對生命科學基礎研究的促進作用
（1）微生物是生命科學工作者經常選用的研究對象，微生物學的發展促進了生命科學領域許多重大理論問題的研究突破；
（2）微生物學的發展對生命科學研究技術也作出了很大的貢獻，例如顯微鏡和有關製片染色技術，消毒滅菌技術，純種分離、培養技術等；
（3）微生物在人類基因組計劃中起到了先行的“模式生物”的作用，加快了人類基因計劃的實施進展。
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