2、自身免疫病
在異常情況下，機體對自身抗原發生免疫反應，導致機體受到損害，產生自身免疫病。自身免疫病的範圍很廣，如某些男性不育、甲狀腺炎、全身性紅斑狼瘡等。遺傳等因素對自身免疫疾病的發生有著重要的影響。
3、免疫缺陷
機體的免疫係統發育異常，會出現免疫缺陷，因而產生相應的嚴重疾病，難以治療，直接威脅機體的生命。原發性免疫缺陷多係遺傳基因缺陷所致，在免疫係統中的任何部位都可能發生，如缺乏B細胞和T細胞者，若不及時進行相應的骨髓移植，則很快死亡。繼發性免疫缺陷是由病原微生物感染所引起 。繼發性免疫缺陷表現為免疫功能低下，無法戰勝侵入機體的外來抗原，如人類獲得性免疫缺陷綜合征（AIDS），即艾滋病就是 由於感染人類免疫缺陷病毒（HIV）引起的。艾滋病是近年來發現的一種新型傳染病，死亡率很高。正常人感染上HIV，他的免疫係統中的重要成分會遭到嚴重破壞， 細胞、 細胞的免疫功能大為下降，很快發生各種機會性感染和惡性病變，最終死亡。
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